RNA–Protein interactions for RNA: YKL169C

YKL169C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL169C, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL169C	YKL169C	DIC1	Q06143	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RRT8	Q08219	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RDR1	Q08904	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ATX2	Q12067	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RIP1	P08067	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SEC63	P14906	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	MER1	P16523	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SPC110	P32380	944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	MRP4	P32902	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YPK3	P38070	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RTS2	P40962	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	URB2	P47108	1174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ECM27	P47144	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YNL143C	P53908	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ACL4	Q03771	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YRM1	Q12340	786 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RAD61	Q99359	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	MDM10	P18409	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	TYR1	P20049	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	PEX2	P32800	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	MRPL4	P36517	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	PCL6	P40038	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ELP2	P42935	788 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YGL138C	P53122	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ECM18	Q04623	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	MSC3	Q05812	728 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SSK1	Q07084	712 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	GSH2	Q08220	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	PLP2	Q12017	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	BAR1	P12630	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ATP10	P18496	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	URA4	P20051	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	KRE2	P27809	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	PFF1	P38244	976 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RFC3	P38629	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	FLO5	P38894	1075 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YER130C	P39959	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SER3	P40054	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YFR018C	P43599	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YJL132W	P47014	750 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	PRM1	P53835	661 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YNL181W	P53878	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ESBP6	P53918	673 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SMA1	Q02651	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	IZH1	Q03419	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	AEP3	Q12089	606 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	VAM3	Q12241	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YPR089W	O13585	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	CLN1	P20437	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	MRPL25	P23369	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
YKL169C	YKL169C	PHD1	P36093	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	FAD1	P38913	306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	VRG4	P40107	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SYG1	P40528	902 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	IAH1	P41734	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	MDM30	Q05930	598 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	THI20	Q08224	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	BSC1	Q12140	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ARP6	Q12509	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	PDE2	P06776	526 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	SPO7	P18410	259 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	YCR007C	P25354	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	PPZ1	P26570	692 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	SIN4	P32259	974 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	HIR2	P32480	875 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	UTR4	P32626	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	PDR3	P33200	976 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL169C	YKL169C	MLH1	P38920	769 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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