Protein–RNA interactions for Protein: Q08904

RDR1, Protein RDR1, yeastyeast

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Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDR1Q08904 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.49■□□□□ 0.55
RDR1Q08904 NSR1YGR159C 1245 nt18.34■□□□□ 0.53
RDR1Q08904 NOP1YDL014W 984 nt18.07■□□□□ 0.48
RDR1Q08904 YKL036CYKL036C 393 nt16.72■□□□□ 0.27
RDR1Q08904 MDJ1YFL016C 1536 nt16.41■□□□□ 0.22
RDR1Q08904 Q0297Q0297 156 nt15.8■□□□□ 0.12
RDR1Q08904 SRX1YKL086W 384 nt15.75■□□□□ 0.11
RDR1Q08904 YJL027CYJL027C 417 nt15.61■□□□□ 0.09
RDR1Q08904 SCS3YGL126W 1143 nt15.22■□□□□ 0.03
RDR1Q08904 YCR051WYCR051W 669 nt14.94□□□□□ -0.02
RDR1Q08904 DBP2YNL112W 1641 nt14.51□□□□□ -0.09
RDR1Q08904 YOL085CYOL085C 342 nt14.44□□□□□ -0.1
RDR1Q08904 RPP1BYDL130W 321 nt14.18□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 PKP1YIL042C 1185 nt14.18□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.17□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.17□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.17□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.17□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.17□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.17□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.17□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.17□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.17□□□□□ -0.14
RDR1Q08904 YBR190WYBR190W 312 nt14.02□□□□□ -0.17
RDR1Q08904 CCC1YLR220W 969 nt14.01□□□□□ -0.17
RDR1Q08904 RTC3YHR087W 336 nt13.67□□□□□ -0.22
RDR1Q08904 SCJ1YMR214W 1134 nt13.66□□□□□ -0.22
RDR1Q08904 ATS1YAL020C 1002 nt13.64□□□□□ -0.23
RDR1Q08904 RVS167YDR388W 1449 nt13.56□□□□□ -0.24
RDR1Q08904 PET122YER153C 765 nt13.5□□□□□ -0.25
RDR1Q08904 SCR1SCR1 522 nt13.46□□□□□ -0.25
RDR1Q08904 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.43□□□□□ -0.26
RDR1Q08904 RRN5YLR141W 1092 nt13.12□□□□□ -0.31
RDR1Q08904 SSA3YBL075C 1950 nt13.08□□□□□ -0.32
RDR1Q08904 SHR5YOL110W 714 nt13.07□□□□□ -0.32
RDR1Q08904 YDJ1YNL064C 1230 nt13.03□□□□□ -0.32
RDR1Q08904 RSB1YOR049C 1065 nt12.9□□□□□ -0.34
RDR1Q08904 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.87□□□□□ -0.35
RDR1Q08904 PUT4YOR348C 1884 nt12.87□□□□□ -0.35
RDR1Q08904 URN1YPR152C 1398 nt12.78□□□□□ -0.36
RDR1Q08904 DEP1YAL013W 1218 nt12.73□□□□□ -0.37
RDR1Q08904 GAR1YHR089C 618 nt12.68□□□□□ -0.38
RDR1Q08904 OPI9YLR338W 858 nt12.63□□□□□ -0.39
RDR1Q08904 PST2YDR032C 597 nt12.61□□□□□ -0.39
RDR1Q08904 ARE1YCR048W 1833 nt12.59□□□□□ -0.39
RDR1Q08904 SAH1YER043C 1350 nt12.58□□□□□ -0.4
RDR1Q08904 RPN10YHR200W 807 nt12.54□□□□□ -0.4
RDR1Q08904 YNL208WYNL208W 600 nt12.52□□□□□ -0.41
RDR1Q08904 POA1YBR022W 534 nt12.42□□□□□ -0.42
RDR1Q08904 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.4□□□□□ -0.42
RDR1Q08904 TIR1YER011W 765 nt12.27□□□□□ -0.45
RDR1Q08904 PUN1YLR414C 792 nt12.25□□□□□ -0.45
RDR1Q08904 YKL097CYKL097C 411 nt12.19□□□□□ -0.46
RDR1Q08904 BSC6YOL137W 1494 nt12.19□□□□□ -0.46
RDR1Q08904 YJR018WYJR018W 363 nt12.18□□□□□ -0.46
RDR1Q08904 PTC2YER089C 1395 nt12.12□□□□□ -0.47
RDR1Q08904 SSA1YAL005C 1929 nt12.11□□□□□ -0.47
RDR1Q08904 BUD23YCR047C 828 nt12.08□□□□□ -0.48
RDR1Q08904 SHU1YHL006C 453 nt12.06□□□□□ -0.48
RDR1Q08904 YJR120WYJR120W 351 nt12.02□□□□□ -0.49
RDR1Q08904 NAB2YGL122C 1578 nt11.98□□□□□ -0.49
RDR1Q08904 SRB2YHR041C 633 nt11.91□□□□□ -0.5
RDR1Q08904 RPP2BYDR382W 333 nt11.9□□□□□ -0.5
RDR1Q08904 FIS1YIL065C 468 nt11.83□□□□□ -0.52
RDR1Q08904 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.82□□□□□ -0.52
RDR1Q08904 DAL1YIR027C 1383 nt11.8□□□□□ -0.52
RDR1Q08904 SPT5YML010W 3192 nt11.78□□□□□ -0.52
RDR1Q08904 INM2YDR287W 879 nt11.76□□□□□ -0.53
RDR1Q08904 YGR021WYGR021W 873 nt11.75□□□□□ -0.53
RDR1Q08904 FPR4YLR449W 1179 nt11.74□□□□□ -0.53
RDR1Q08904 WWM1YFL010C 636 nt11.71□□□□□ -0.53
RDR1Q08904 PHO4YFR034C 939 nt11.7□□□□□ -0.54
RDR1Q08904 HOM6YJR139C 1080 nt11.65□□□□□ -0.54
RDR1Q08904 BDH2YAL061W 1254 nt11.65□□□□□ -0.54
RDR1Q08904 YBL100CYBL100C 315 nt11.63□□□□□ -0.55
RDR1Q08904 YOR139CYOR139C 393 nt11.63□□□□□ -0.55
RDR1Q08904 NPL3YDR432W 1245 nt11.58□□□□□ -0.56
RDR1Q08904 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.58□□□□□ -0.56
RDR1Q08904 MNP1YGL068W 585 nt11.58□□□□□ -0.56
RDR1Q08904 SSA4YER103W 1929 nt11.54□□□□□ -0.56
RDR1Q08904 YPS1YLR120C 1710 nt11.53□□□□□ -0.56
RDR1Q08904 LSM3YLR438C-A 270 nt11.53□□□□□ -0.56
RDR1Q08904 YOL037CYOL037C 354 nt11.51□□□□□ -0.57
RDR1Q08904 FUN26YAL022C 1554 nt11.5□□□□□ -0.57
RDR1Q08904 RKM5YLR137W 1104 nt11.49□□□□□ -0.57
RDR1Q08904 Q0182Q0182 405 nt11.47□□□□□ -0.57
RDR1Q08904 MEP2YNL142W 1500 nt11.45□□□□□ -0.58
RDR1Q08904 YDR095CYDR095C 411 nt11.44□□□□□ -0.58
RDR1Q08904 TRM9YML014W 840 nt11.43□□□□□ -0.58
RDR1Q08904 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.37□□□□□ -0.59
RDR1Q08904 CCT6YDR188W 1641 nt11.35□□□□□ -0.59
RDR1Q08904 ALF1YNL148C 765 nt11.32□□□□□ -0.6
RDR1Q08904 DCW1YKL046C 1350 nt11.28□□□□□ -0.6
RDR1Q08904 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.23□□□□□ -0.61
RDR1Q08904 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.23□□□□□ -0.61
RDR1Q08904 PTP1YDL230W 1008 nt11.21□□□□□ -0.61
RDR1Q08904 SIS1YNL007C 1059 nt11.21□□□□□ -0.61
RDR1Q08904 RPP2AYOL039W 321 nt11.21□□□□□ -0.61
RDR1Q08904 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.19□□□□□ -0.62
RDR1Q08904 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.19□□□□□ -0.62
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