RNA–Protein interactions for RNA: YKL169C

YKL169C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL169C, Length 384 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL169CYKL169C DRS1P32892 752 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
YKL169CYKL169C MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
YKL169CYKL169C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
YKL169CYKL169C TFA1P36100 482 aa12.2□□□□□ -0.46
YKL169CYKL169C AVT3P36062 692 aa12.01□□□□□ -0.49
YKL169CYKL169C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
YKL169CYKL169C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
YKL169CYKL169C ISW2Q08773 1120 aa11.01□□□□□ -0.65
YKL169CYKL169C RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
YKL169CYKL169C PRI1P10363 409 aa10.79□□□□□ -0.68
YKL169CYKL169C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
YKL169CYKL169C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
YKL169CYKL169C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
YKL169CYKL169C FAP1P53971 965 aa10.58□□□□□ -0.72
YKL169CYKL169C AAD16Q02895 342 aa10.51□□□□□ -0.73
YKL169CYKL169C REB1P21538 810 aa10.46□□□□□ -0.73
YKL169CYKL169C SPT21P35209 758 aa10.46□□□□□ -0.73
YKL169CYKL169C RIM101P33400 625 aa10.4□□□□□ -0.74
YKL169CYKL169C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
YKL169CYKL169C PTP3P40048 928 aa10.21□□□□□ -0.77
YKL169CYKL169C DMA1P38823 416 aa10.15□□□□□ -0.78
YKL169CYKL169C OXP1P28273 1286 aa10.11□□□□□ -0.79
YKL169CYKL169C SSP1P38871 571 aa10.1□□□□□ -0.79
YKL169CYKL169C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
YKL169CYKL169C PRY3P47033 881 aa9.92□□□□□ -0.82
YKL169CYKL169C YLR271WQ06152 274 aa9.88□□□□□ -0.83
YKL169CYKL169C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
YKL169CYKL169C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data9.84□□□□□ -0.83not detected
YKL169CYKL169C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
YKL169CYKL169C MRPL32P25348 183 aa9.79□□□□□ -0.84
YKL169CYKL169C TFC8Q12308 588 aa9.77□□□□□ -0.85
YKL169CYKL169C RSM7P47150 247 aa9.74□□□□□ -0.85
YKL169CYKL169C HOP09932 586 aa9.71□□□□□ -0.86
YKL169CYKL169C MGA2P40578 1113 aa9.7□□□□□ -0.86
YKL169CYKL169C CDC27P38042 758 aa9.65□□□□□ -0.86
YKL169CYKL169C YCK3P39962 524 aa9.63□□□□□ -0.87
YKL169CYKL169C DCD1P06773 312 aa9.61□□□□□ -0.87
YKL169CYKL169C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
YKL169CYKL169C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
YKL169CYKL169C CST9Q06032 482 aa9.58□□□□□ -0.88
YKL169CYKL169C AI2P03876 854 aa9.52□□□□□ -0.89
YKL169CYKL169C LEO1P38439 464 aa9.52□□□□□ -0.89
YKL169CYKL169C TAF7Q05021 590 aa9.51□□□□□ -0.89
YKL169CYKL169C BCH2P36122 765 aa9.49□□□□□ -0.89
YKL169CYKL169C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
YKL169CYKL169C LEU3P08638 886 aa9.41□□□□□ -0.9
YKL169CYKL169C BBC1P47068 1157 aa9.38□□□□□ -0.91
YKL169CYKL169C EPS1P40557 701 aa9.35□□□□□ -0.91
YKL169CYKL169C RAM2P29703 316 aa9.34□□□□□ -0.91
YKL169CYKL169C BDF1P35817 686 aa9.28□□□□□ -0.92
YKL169CYKL169C MRM1P25270 412 aa9.24□□□□□ -0.93
YKL169CYKL169C RCR1P38212 213 aa9.22□□□□□ -0.93
YKL169CYKL169C YPR148CQ06523 435 aa9.21□□□□□ -0.94
YKL169CYKL169C SET1P38827 1080 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
YKL169CYKL169C SCY1P53009 804 aa9.19□□□□□ -0.94
YKL169CYKL169C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
YKL169CYKL169C RTG3P38165 486 aa9.16□□□□□ -0.94
YKL169CYKL169C MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
YKL169CYKL169C MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
YKL169CYKL169C CKB1P43639 278 aa9.1□□□□□ -0.95
YKL169CYKL169C VPS29P38759 282 aa9.09□□□□□ -0.95
YKL169CYKL169C IFH1P39520 1085 aa9.09□□□□□ -0.95
YKL169CYKL169C RPN1P38764 993 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
YKL169CYKL169C VPS70P47161 811 aa9.06□□□□□ -0.96
YKL169CYKL169C YGL015CP33199 130 aa9□□□□□ -0.97
YKL169CYKL169C COQ8P27697 501 aa8.99□□□□□ -0.97
YKL169CYKL169C SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
YKL169CYKL169C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
YKL169CYKL169C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
YKL169CYKL169C DSF2P38213 736 aa8.96□□□□□ -0.98
YKL169CYKL169C STS1P38637 319 aa8.93□□□□□ -0.98
YKL169CYKL169C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.93□□□□□ -0.98not detected
YKL169CYKL169C EDS1P38073 919 aa8.91□□□□□ -0.98
YKL169CYKL169C PBS2P08018 668 aa8.88□□□□□ -0.99
YKL169CYKL169C DMA2P53924 522 aa8.86□□□□□ -0.99
YKL169CYKL169C DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
YKL169CYKL169C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.84□□□□□ -0.99not detected
YKL169CYKL169C MIF2P35201 549 aa8.82□□□□□ -1
YKL169CYKL169C YFR006WP43590 535 aa8.82□□□□□ -1
YKL169CYKL169C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YKL169CYKL169C REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
YKL169CYKL169C YOR238WQ08634 303 aa8.81□□□□□ -1
YKL169CYKL169C PTC3P34221 468 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
YKL169CYKL169C NUP42P49686 430 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
YKL169CYKL169C MAM3Q12296 706 aa8.75□□□□□ -1.01
YKL169CYKL169C KIN1P13185 1064 aa8.73□□□□□ -1.01
YKL169CYKL169C ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
YKL169CYKL169C AIM7Q12156 149 aa8.73□□□□□ -1.01
YKL169CYKL169C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
YKL169CYKL169C IES2P40154 320 aa8.72□□□□□ -1.01
YKL169CYKL169C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
YKL169CYKL169C TGL3P40308 642 aa8.71□□□□□ -1.02
YKL169CYKL169C COX6P00427 148 aa8.7□□□□□ -1.02
YKL169CYKL169C DIT2P21595 489 aa8.7□□□□□ -1.02
YKL169CYKL169C YAP5P40574 245 aa8.7□□□□□ -1.02
YKL169CYKL169C GLC3P32775 704 aa8.69□□□□□ -1.02
YKL169CYKL169C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YKL169CYKL169C YDR090CQ03193 310 aa8.65□□□□□ -1.02
YKL169CYKL169C UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YKL169CYKL169C PIB1Q06651 286 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.8 ms