RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	RAD24	P32641	659 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ROT2	P38138	954 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	STN1	P38960	494 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	RRT5	P43607	289 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	YJL132W	P47014	750 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	YGR111W	P53265	400 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	SAM50	P53969	484 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	RMD5	Q12508	421 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ACH1	P32316	526 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	YND1	P40009	630 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	CHS6	P40955	746 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	TOF1	P53840	1238 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ERO1	Q03103	563 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ARP6	Q12509	438 aa		3.69	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	OCA2	P53949	197 aa		3.68	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	MCP2	Q06567	569 aa		3.68	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ECM15	P35195	104 aa		3.68	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	IAH1	P41734	238 aa		3.68	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	EFM3	P47163	339 aa		3.68	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	SSK1	Q07084	712 aa		3.68	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	CTF3	Q12748	733 aa		3.68	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ATS1	P31386	333 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	STP2	P38704	541 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	PHO86	P46956	311 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	HSP31	Q04432	237 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ANP1	P32629	500 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	TOA1	P32773	286 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	SIF2	P38262	535 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	VPS52	P39904	641 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	CUL3	P53202	744 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	YNL181W	P53878	407 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	PSY3	Q12318	242 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	RHB1	P25378	209 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	MGR1	P25573	417 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	SWH1	P35845	1188 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	VPS25	P47142	202 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ECI1	Q05871	280 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	SOR2	Q07786	357 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	FRE6	Q12473	712 aa		3.67	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	URA4	P20051	364 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	RPB8	P20436	146 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	BEM1	P29366	551 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ASK1	P35734	292 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	MDE1	P47095	244 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	YGL138C	P53122	345 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	YPL068C	Q02749	293 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	RDR1	Q08904	546 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	FRE1	P32791	686 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	UIP5	P36137	443 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	GPI16	P38875	610 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	HAT2	P39984	401 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	MSS11	Q03825	758 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	GYL1	Q04322	720 aa		3.66	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	RGT1	P32862	1170 aa		3.65	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	YAL037W	P39728	267 aa		3.65	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	URH1	Q04179	340 aa		3.65	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.82
DSS1	YMR287C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	COS1	P53822	381 aa		3.65	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	ARA1	P38115	344 aa		3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	VHC1	P38329	1120 aa		3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	TOS2	P50078	622 aa		3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	NFI1	Q12216	726 aa		3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	MTR10	Q99189	972 aa		3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	HNM1	P19807	563 aa		3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	TFB1	P32776	642 aa		3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	PES4	P39684	611 aa		3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	XBP1	P40489	647 aa		3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
DSS1	YMR287C	DUG3	P53871	357 aa		3.64	□□□□□ -1.83

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