Protein–RNA interactions for Protein: P38138

ROT2, Glucosidase 2 subunit alpha, yeastyeast

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Length 954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROT2P38138 NSR1YGR159C 1245 nt19.5■□□□□ 0.71
ROT2P38138 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.36■□□□□ 0.69
ROT2P38138 NOP1YDL014W 984 nt18.63■□□□□ 0.57
ROT2P38138 MDJ1YFL016C 1536 nt17.71■□□□□ 0.43
ROT2P38138 YKL036CYKL036C 393 nt16.88■□□□□ 0.29
ROT2P38138 SRX1YKL086W 384 nt16.29■□□□□ 0.2
ROT2P38138 YJL027CYJL027C 417 nt16.27■□□□□ 0.2
ROT2P38138 Q0297Q0297 156 nt16.2■□□□□ 0.18
ROT2P38138 DBP2YNL112W 1641 nt15.51■□□□□ 0.07
ROT2P38138 YCR051WYCR051W 669 nt15.47■□□□□ 0.07
ROT2P38138 SCS3YGL126W 1143 nt15.21■□□□□ 0.03
ROT2P38138 YBR190WYBR190W 312 nt15.14■□□□□ 0.01
ROT2P38138 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.94□□□□□ -0.02
ROT2P38138 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.94□□□□□ -0.02
ROT2P38138 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.94□□□□□ -0.02
ROT2P38138 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.94□□□□□ -0.02
ROT2P38138 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.94□□□□□ -0.02
ROT2P38138 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.94□□□□□ -0.02
ROT2P38138 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.94□□□□□ -0.02
ROT2P38138 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.94□□□□□ -0.02
ROT2P38138 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.94□□□□□ -0.02
ROT2P38138 CCC1YLR220W 969 nt14.84□□□□□ -0.03
ROT2P38138 RTC3YHR087W 336 nt14.82□□□□□ -0.04
ROT2P38138 YOL085CYOL085C 342 nt14.65□□□□□ -0.06
ROT2P38138 RPP1BYDL130W 321 nt14.55□□□□□ -0.08
ROT2P38138 PKP1YIL042C 1185 nt14.52□□□□□ -0.09
ROT2P38138 RVS167YDR388W 1449 nt14.46□□□□□ -0.09
ROT2P38138 SCJ1YMR214W 1134 nt14.36□□□□□ -0.11
ROT2P38138 PUT4YOR348C 1884 nt14.04□□□□□ -0.16
ROT2P38138 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.04□□□□□ -0.16
ROT2P38138 PET122YER153C 765 nt13.97□□□□□ -0.17
ROT2P38138 SSA3YBL075C 1950 nt13.93□□□□□ -0.18
ROT2P38138 SHR5YOL110W 714 nt13.88□□□□□ -0.19
ROT2P38138 URN1YPR152C 1398 nt13.74□□□□□ -0.21
ROT2P38138 SCR1SCR1 522 nt13.69□□□□□ -0.22
ROT2P38138 ARE1YCR048W 1833 nt13.69□□□□□ -0.22
ROT2P38138 DEP1YAL013W 1218 nt13.67□□□□□ -0.22
ROT2P38138 SAH1YER043C 1350 nt13.63□□□□□ -0.23
ROT2P38138 OPI9YLR338W 858 nt13.59□□□□□ -0.23
ROT2P38138 POA1YBR022W 534 nt13.59□□□□□ -0.23
ROT2P38138 YDJ1YNL064C 1230 nt13.55□□□□□ -0.24
ROT2P38138 RRN5YLR141W 1092 nt13.54□□□□□ -0.24
ROT2P38138 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.51□□□□□ -0.25
ROT2P38138 ATS1YAL020C 1002 nt13.5□□□□□ -0.25
ROT2P38138 RPN10YHR200W 807 nt13.41□□□□□ -0.26
ROT2P38138 GAR1YHR089C 618 nt13.36□□□□□ -0.27
ROT2P38138 YNL208WYNL208W 600 nt13.36□□□□□ -0.27
ROT2P38138 BSC6YOL137W 1494 nt13.35□□□□□ -0.27
ROT2P38138 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.26□□□□□ -0.29
ROT2P38138 BUD23YCR047C 828 nt13.19□□□□□ -0.3
ROT2P38138 PUN1YLR414C 792 nt13.18□□□□□ -0.3
ROT2P38138 RSB1YOR049C 1065 nt13.15□□□□□ -0.3
ROT2P38138 PTC2YER089C 1395 nt13.11□□□□□ -0.31
ROT2P38138 YJR018WYJR018W 363 nt13.08□□□□□ -0.32
ROT2P38138 NAB2YGL122C 1578 nt12.97□□□□□ -0.33
ROT2P38138 SPT5YML010W 3192 nt12.97□□□□□ -0.33
ROT2P38138 TIR1YER011W 765 nt12.9□□□□□ -0.34
ROT2P38138 SSA1YAL005C 1929 nt12.84□□□□□ -0.35
ROT2P38138 YJR120WYJR120W 351 nt12.82□□□□□ -0.36
ROT2P38138 FIS1YIL065C 468 nt12.76□□□□□ -0.37
ROT2P38138 FPR4YLR449W 1179 nt12.74□□□□□ -0.37
ROT2P38138 DAL1YIR027C 1383 nt12.73□□□□□ -0.37
ROT2P38138 RPP2BYDR382W 333 nt12.69□□□□□ -0.38
ROT2P38138 SSA4YER103W 1929 nt12.67□□□□□ -0.38
ROT2P38138 INM2YDR287W 879 nt12.63□□□□□ -0.39
ROT2P38138 PHO4YFR034C 939 nt12.62□□□□□ -0.39
ROT2P38138 SRB2YHR041C 633 nt12.6□□□□□ -0.39
ROT2P38138 PST2YDR032C 597 nt12.56□□□□□ -0.4
ROT2P38138 MEP2YNL142W 1500 nt12.56□□□□□ -0.4
ROT2P38138 YPS1YLR120C 1710 nt12.5□□□□□ -0.41
ROT2P38138 YBL100CYBL100C 315 nt12.47□□□□□ -0.41
ROT2P38138 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.39□□□□□ -0.43
ROT2P38138 BDH2YAL061W 1254 nt12.39□□□□□ -0.43
ROT2P38138 DCW1YKL046C 1350 nt12.39□□□□□ -0.43
ROT2P38138 YDR095CYDR095C 411 nt12.35□□□□□ -0.43
ROT2P38138 FUN26YAL022C 1554 nt12.32□□□□□ -0.44
ROT2P38138 WWM1YFL010C 636 nt12.3□□□□□ -0.44
ROT2P38138 TRM9YML014W 840 nt12.23□□□□□ -0.45
ROT2P38138 ALF1YNL148C 765 nt12.21□□□□□ -0.45
ROT2P38138 BDF1YLR399C 2061 nt12.21□□□□□ -0.45
ROT2P38138 EMI2YDR516C 1503 nt12.2□□□□□ -0.46
ROT2P38138 SHU1YHL006C 453 nt12.15□□□□□ -0.46
ROT2P38138 LSM3YLR438C-A 270 nt12.15□□□□□ -0.46
ROT2P38138 PTP1YDL230W 1008 nt12.13□□□□□ -0.47
ROT2P38138 RPP2AYOL039W 321 nt12.13□□□□□ -0.47
ROT2P38138 CAC2YML102W 1407 nt12.12□□□□□ -0.47
ROT2P38138 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.12□□□□□ -0.47
ROT2P38138 CCT6YDR188W 1641 nt12.11□□□□□ -0.47
ROT2P38138 YMR090WYMR090W 684 nt12.1□□□□□ -0.47
ROT2P38138 YBR220CYBR220C 1683 nt12.07□□□□□ -0.48
ROT2P38138 YDL221WYDL221W 552 nt12.06□□□□□ -0.48
ROT2P38138 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.06□□□□□ -0.48
ROT2P38138 YGR021WYGR021W 873 nt12.06□□□□□ -0.48
ROT2P38138 HOM6YJR139C 1080 nt12.03□□□□□ -0.48
ROT2P38138 TAT1YBR069C 1860 nt12.02□□□□□ -0.48
ROT2P38138 SIS1YNL007C 1059 nt12.02□□□□□ -0.49
ROT2P38138 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.01□□□□□ -0.49
ROT2P38138 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.01□□□□□ -0.49
ROT2P38138 SDH1YKL148C 1923 nt11.99□□□□□ -0.49
ROT2P38138 MNP1YGL068W 585 nt11.96□□□□□ -0.49
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