RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	YLR456W	Q06199	204 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	ENT4	Q07872	247 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	APC5	Q08683	685 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	CTF3	Q12748	733 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SAC3	P46674	1301 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	PUT2	P07275	575 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	ERG8	P24521	451 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	GRR1	P24814	1151 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YME1	P32795	747 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RIB7	P33312	244 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	CST26	P38226	397 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	DBP8	P38719	431 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	WSS1	P38838	269 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SLZ1	P40167	298 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	MDE1	P47095	244 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RNH1	Q04740	348 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YEH1	Q07804	573 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	MDY2	Q12285	212 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	GPM3	Q12326	303 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.73	□□□□□ -1.81	not detected
NEM1	YHR004C	MSP1	P28737	362 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SYN8	P31377	255 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	LTV1	P34078	463 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	ALY1	P36117	915 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SIF2	P38262	535 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YHR054C	P38780	354 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YIL089W	P40500	205 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YGR111W	P53265	400 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	REG1	Q00816	1014 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RRN5	Q02983	363 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	MHR1	Q06630	226 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	DCI1	Q08558	271 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	AFI1	Q99222	893 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YEL043W	P32618	956 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	MAL33	P38157	468 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	VPS52	P39904	641 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SHO1	P40073	367 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	WSC2	P53832	503 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RHO4	Q00246	291 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YPL014W	Q02606	381 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	KAP120	Q02932	1032 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	NGL3	Q03210	505 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	HOT1	Q03213	719 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YDR239C	Q03780	787 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	ROY1	Q04847	553 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	VPS38	Q05919	439 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SPH1	Q06160	661 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	VTA1	Q06263	330 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	ATG29	Q12092	213 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	VCX1	Q99385	411 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	INO80	P53115	1489 aa		3.72	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	QCR6	P00127	147 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	APE1	P14904	514 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	POL4	P25615	582 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	PPQ1	P32945	549 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YBL059W	P34224	193 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	CMC1	P36064	111 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	TSC10	P38342	320 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YEL057C	P39983	233 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	OSW5	P40219	148 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	ALG8	P40351	577 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	DOT5	P40553	215 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YGR210C	P42942	411 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	VID30	P53076	958 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	MLC1	P53141	149 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	DON1	Q05610	365 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YDR061W	Q12298	539 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	AVL9	Q12500	764 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YOR019W	Q99248	730 aa		3.71	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.7	□□□□□ -1.82

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