Protein–RNA interactions for Protein: Q00246

RHO4, GTP-binding protein RHO4, yeastyeast

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RHO4Q00246 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.2■□□□□ 0.66
RHO4Q00246 NSR1YGR159C 1245 nt19.13■□□□□ 0.65
RHO4Q00246 NOP1YDL014W 984 nt18.63■□□□□ 0.57
RHO4Q00246 YKL036CYKL036C 393 nt17.12■□□□□ 0.33
RHO4Q00246 MDJ1YFL016C 1536 nt17.09■□□□□ 0.33
RHO4Q00246 Q0297Q0297 156 nt16.28■□□□□ 0.2
RHO4Q00246 SRX1YKL086W 384 nt16.27■□□□□ 0.2
RHO4Q00246 YJL027CYJL027C 417 nt15.97■□□□□ 0.15
RHO4Q00246 SCS3YGL126W 1143 nt15.54■□□□□ 0.08
RHO4Q00246 YCR051WYCR051W 669 nt15.44■□□□□ 0.06
RHO4Q00246 DBP2YNL112W 1641 nt15.08■□□□□ 0
RHO4Q00246 YOL085CYOL085C 342 nt14.84□□□□□ -0.03
RHO4Q00246 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.77□□□□□ -0.05
RHO4Q00246 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.77□□□□□ -0.05
RHO4Q00246 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.77□□□□□ -0.05
RHO4Q00246 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.77□□□□□ -0.05
RHO4Q00246 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.77□□□□□ -0.05
RHO4Q00246 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.77□□□□□ -0.05
RHO4Q00246 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.77□□□□□ -0.05
RHO4Q00246 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.77□□□□□ -0.05
RHO4Q00246 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.77□□□□□ -0.05
RHO4Q00246 PKP1YIL042C 1185 nt14.63□□□□□ -0.07
RHO4Q00246 CCC1YLR220W 969 nt14.62□□□□□ -0.07
RHO4Q00246 RPP1BYDL130W 321 nt14.61□□□□□ -0.07
RHO4Q00246 YBR190WYBR190W 312 nt14.57□□□□□ -0.08
RHO4Q00246 RTC3YHR087W 336 nt14.26□□□□□ -0.13
RHO4Q00246 RVS167YDR388W 1449 nt14.15□□□□□ -0.14
RHO4Q00246 SCJ1YMR214W 1134 nt14.1□□□□□ -0.15
RHO4Q00246 PET122YER153C 765 nt13.98□□□□□ -0.17
RHO4Q00246 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.94□□□□□ -0.18
RHO4Q00246 ATS1YAL020C 1002 nt13.87□□□□□ -0.19
RHO4Q00246 SCR1SCR1 522 nt13.79□□□□□ -0.2
RHO4Q00246 SHR5YOL110W 714 nt13.65□□□□□ -0.22
RHO4Q00246 RRN5YLR141W 1092 nt13.56□□□□□ -0.24
RHO4Q00246 YDJ1YNL064C 1230 nt13.49□□□□□ -0.25
RHO4Q00246 URN1YPR152C 1398 nt13.32□□□□□ -0.28
RHO4Q00246 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.3□□□□□ -0.28
RHO4Q00246 DEP1YAL013W 1218 nt13.3□□□□□ -0.28
RHO4Q00246 SSA3YBL075C 1950 nt13.3□□□□□ -0.28
RHO4Q00246 PUT4YOR348C 1884 nt13.29□□□□□ -0.28
RHO4Q00246 RSB1YOR049C 1065 nt13.27□□□□□ -0.29
RHO4Q00246 GAR1YHR089C 618 nt13.21□□□□□ -0.29
RHO4Q00246 OPI9YLR338W 858 nt13.13□□□□□ -0.31
RHO4Q00246 RPN10YHR200W 807 nt13.1□□□□□ -0.31
RHO4Q00246 SAH1YER043C 1350 nt13.08□□□□□ -0.31
RHO4Q00246 YNL208WYNL208W 600 nt13.07□□□□□ -0.32
RHO4Q00246 ARE1YCR048W 1833 nt13.03□□□□□ -0.32
RHO4Q00246 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.88□□□□□ -0.35
RHO4Q00246 POA1YBR022W 534 nt12.88□□□□□ -0.35
RHO4Q00246 PST2YDR032C 597 nt12.86□□□□□ -0.35
RHO4Q00246 TIR1YER011W 765 nt12.76□□□□□ -0.37
RHO4Q00246 PUN1YLR414C 792 nt12.75□□□□□ -0.37
RHO4Q00246 YJR018WYJR018W 363 nt12.69□□□□□ -0.38
RHO4Q00246 SSA1YAL005C 1929 nt12.62□□□□□ -0.39
RHO4Q00246 BSC6YOL137W 1494 nt12.62□□□□□ -0.39
RHO4Q00246 PTC2YER089C 1395 nt12.61□□□□□ -0.39
RHO4Q00246 BUD23YCR047C 828 nt12.57□□□□□ -0.4
RHO4Q00246 YJR120WYJR120W 351 nt12.51□□□□□ -0.41
RHO4Q00246 NAB2YGL122C 1578 nt12.45□□□□□ -0.42
RHO4Q00246 SRB2YHR041C 633 nt12.43□□□□□ -0.42
RHO4Q00246 RPP2BYDR382W 333 nt12.41□□□□□ -0.42
RHO4Q00246 SHU1YHL006C 453 nt12.36□□□□□ -0.43
RHO4Q00246 YKL097CYKL097C 411 nt12.31□□□□□ -0.44
RHO4Q00246 FIS1YIL065C 468 nt12.29□□□□□ -0.44
RHO4Q00246 DAL1YIR027C 1383 nt12.28□□□□□ -0.44
RHO4Q00246 FPR4YLR449W 1179 nt12.26□□□□□ -0.45
RHO4Q00246 INM2YDR287W 879 nt12.24□□□□□ -0.45
RHO4Q00246 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.2□□□□□ -0.46
RHO4Q00246 WWM1YFL010C 636 nt12.19□□□□□ -0.46
RHO4Q00246 PHO4YFR034C 939 nt12.17□□□□□ -0.46
RHO4Q00246 BDH2YAL061W 1254 nt12.15□□□□□ -0.46
RHO4Q00246 YBL100CYBL100C 315 nt12.13□□□□□ -0.47
RHO4Q00246 YGR021WYGR021W 873 nt12.09□□□□□ -0.47
RHO4Q00246 HOM6YJR139C 1080 nt12.05□□□□□ -0.48
RHO4Q00246 SPT5YML010W 3192 nt12.04□□□□□ -0.48
RHO4Q00246 MNP1YGL068W 585 nt12□□□□□ -0.49
RHO4Q00246 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.99□□□□□ -0.49
RHO4Q00246 FUN26YAL022C 1554 nt11.98□□□□□ -0.49
RHO4Q00246 LSM3YLR438C-A 270 nt11.98□□□□□ -0.49
RHO4Q00246 YPS1YLR120C 1710 nt11.94□□□□□ -0.5
RHO4Q00246 TRM9YML014W 840 nt11.93□□□□□ -0.5
RHO4Q00246 YDR095CYDR095C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
RHO4Q00246 RKM5YLR137W 1104 nt11.88□□□□□ -0.51
RHO4Q00246 MEP2YNL142W 1500 nt11.85□□□□□ -0.51
RHO4Q00246 YOR139CYOR139C 393 nt11.84□□□□□ -0.51
RHO4Q00246 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.83□□□□□ -0.52
RHO4Q00246 ALF1YNL148C 765 nt11.83□□□□□ -0.52
RHO4Q00246 CCT6YDR188W 1641 nt11.82□□□□□ -0.52
RHO4Q00246 YOL037CYOL037C 354 nt11.76□□□□□ -0.53
RHO4Q00246 NPL3YDR432W 1245 nt11.75□□□□□ -0.53
RHO4Q00246 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.72□□□□□ -0.53
RHO4Q00246 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.72□□□□□ -0.53
RHO4Q00246 DCW1YKL046C 1350 nt11.67□□□□□ -0.54
RHO4Q00246 SSA4YER103W 1929 nt11.67□□□□□ -0.54
RHO4Q00246 SIS1YNL007C 1059 nt11.65□□□□□ -0.54
RHO4Q00246 RPP2AYOL039W 321 nt11.65□□□□□ -0.54
RHO4Q00246 PTP1YDL230W 1008 nt11.62□□□□□ -0.55
RHO4Q00246 CAC2YML102W 1407 nt11.52□□□□□ -0.56
RHO4Q00246 EMI2YDR516C 1503 nt11.51□□□□□ -0.57
RHO4Q00246 YLR281CYLR281C 468 nt11.49□□□□□ -0.57
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