RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174831.7

Ptprd-220, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ptprd, Length 4,518 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gm20521D3Z5F7 333 aa9.25□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 OvosQ3UU35 1456 aa9.24□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Bcl11bQ99PV8 884 aa9.24□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 UacaQ8CGB3 1411 aa9.23□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 AI481877A2ALV5 1481 aa9.23□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cabp1Q9JLK7 227 aa9.23□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Magi1Q6RHR9 1471 aa9.23□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Nsd2Q8BVE8 1365 aa9.23□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pip4k2bQ80XI4 416 aa9.22□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Wdr7Q920I9 1489 aa9.21□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa9.21□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 NrdcQ8BHG1 1161 aa9.21□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Fancd2Q80V62 1450 aa9.2□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Samd9lQ69Z37 1561 aa9.19□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Mier1Q5UAK0 511 aa9.19□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Kdm2aP59997 1161 aa9.18□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pla2r1Q62028 1487 aa9.18□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Stag3O70576 1240 aa9.17□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Nlrp6Q91WS2 869 aa9.17□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rgl3Q3UYI5 709 aa9.17□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Afap1Q80YS6 731 aa9.17□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Stard8Q8K031 1019 aa9.16□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cep170Q6A065 1588 aa9.16□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Atf3Q60765 181 aa9.15□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Caskin1Q6P9K8 1431 aa9.15□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa9.15□□□□□ -0.94
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Zbtb4Q5F293 982 aa9.14□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 PtprtQ99M80 1454 aa9.13□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Mug1P28665 1476 aa9.12□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Magi3Q9EQJ9 1476 aa9.12□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ecm2Q5FW85 670 aa9.12□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ap3b2Q9JME5 1082 aa9.12□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Trak1Q6PD31 939 aa9.11□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa9.11□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 NgefQ8CHT1 710 aa9.11□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 ErbinQ80TH2 1402 aa9.11□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 WizO88286 1684 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Map3k5O35099 1380 aa9.1□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Unc13aQ4KUS2 1712 aa9.1□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Synj2Q9D2G5 1434 aa9.1□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 PxdnQ3UQ28 1475 aa9.09□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pde4cQ3UEI1 686 aa9.09□□□□□ -0.95
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa9.08□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Arap1Q4LDD4 1452 aa9.08□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pkd2O35245 966 aa9.07□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Eid3Q3V124 375 aa9.07□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Col17a1Q07563 1470 aa9.07□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa9.06□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Fhad1A6PWD2 1420 aa9.06□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 NpatQ8BMA5 1420 aa9.06□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Il16O54824 1322 aa9.05□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa9.05□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Camsap2Q8C1B1 1461 aa9.05□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Stk26Q99JT2 416 aa9.05□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Shq1Q7TMX5 569 aa9.04□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gpatch8A2A6A1 1505 aa9.04□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Naip1Q9QWK5 1403 aa9.04□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 CenpjQ569L8 1344 aa9.04□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Mphosph9A6H5Y1 991 aa9.04□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa9.03□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Card11Q8CIS0 1159 aa9.03□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Map3k4O08648 1597 aa9.03□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cfap74Q3UY96 1578 aa9.03□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Naip2Q9QUK4 1447 aa9.03□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa9.03□□□□□ -0.96
Ptprd-220ENSMUST00000174831 ClspnQ80YR7 1315 aa9.02□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa9.02□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Iqcf3Q9D498 203 aa9.02□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Tom1O88746 492 aa9.02□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa9.01□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Sirt1Q923E4 737 aa9.01□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Kdm5bQ80Y84 1544 aa9.01□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 ZgpatQ8VDM1 511 aa9□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Arhgef11Q68FM7 1552 aa8.99□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Sox12Q04890 314 aa8.99□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Evi5lH3BKQ3 813 aa8.99□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 NexmifQ5DTT1 1515 aa8.98□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Adamts12Q811B3 1600 aa8.98□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Fyb1O35601 819 aa8.97□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Zfyve16Q80U44 1528 aa8.97□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 CatipB9EKE5 520 aa8.97□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Aplp2Q06335 707 aa8.96□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gimap5Q8BWF2 308 aa8.96□□□□□ -0.97
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Dmrt2Q8BG36 561 aa8.96□□□□□ -0.98
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cd109Q8R422 1442 aa8.96□□□□□ -0.98
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Slx4Q6P1D7 1565 aa8.96□□□□□ -0.98
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.1 ms