Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.4■■■■■ 5.82
Aplp2Q06335 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
Aplp2Q06335 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
Aplp2Q06335 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Aplp2Q06335 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Aplp2Q06335 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
Aplp2Q06335 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
Aplp2Q06335 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Aplp2Q06335 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
Aplp2Q06335 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
Aplp2Q06335 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Aplp2Q06335 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
Aplp2Q06335 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Aplp2Q06335 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Aplp2Q06335 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Aplp2Q06335 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Aplp2Q06335 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Aplp2Q06335 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
Aplp2Q06335 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Aplp2Q06335 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Aplp2Q06335 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Aplp2Q06335 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Aplp2Q06335 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Aplp2Q06335 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Aplp2Q06335 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Aplp2Q06335 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Aplp2Q06335 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Aplp2Q06335 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Aplp2Q06335 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Aplp2Q06335 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Aplp2Q06335 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Aplp2Q06335 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Aplp2Q06335 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Aplp2Q06335 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Aplp2Q06335 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Aplp2Q06335 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Aplp2Q06335 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Aplp2Q06335 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Aplp2Q06335 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Aplp2Q06335 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Aplp2Q06335 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Aplp2Q06335 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Aplp2Q06335 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
Aplp2Q06335 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Aplp2Q06335 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Aplp2Q06335 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Aplp2Q06335 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Aplp2Q06335 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Aplp2Q06335 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Aplp2Q06335 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Aplp2Q06335 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Aplp2Q06335 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Aplp2Q06335 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Aplp2Q06335 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Aplp2Q06335 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Aplp2Q06335 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Aplp2Q06335 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Aplp2Q06335 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Aplp2Q06335 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Aplp2Q06335 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Aplp2Q06335 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Aplp2Q06335 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Aplp2Q06335 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Aplp2Q06335 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Aplp2Q06335 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Aplp2Q06335 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Aplp2Q06335 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Aplp2Q06335 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Aplp2Q06335 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Aplp2Q06335 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Aplp2Q06335 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Aplp2Q06335 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Aplp2Q06335 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Aplp2Q06335 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Aplp2Q06335 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Aplp2Q06335 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Aplp2Q06335 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Aplp2Q06335 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Aplp2Q06335 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Aplp2Q06335 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Aplp2Q06335 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Aplp2Q06335 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Aplp2Q06335 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Aplp2Q06335 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Aplp2Q06335 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Aplp2Q06335 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Aplp2Q06335 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Aplp2Q06335 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Aplp2Q06335 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Aplp2Q06335 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Aplp2Q06335 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Aplp2Q06335 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Aplp2Q06335 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Aplp2Q06335 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Aplp2Q06335 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Aplp2Q06335 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Aplp2Q06335 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Aplp2Q06335 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Aplp2Q06335 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Aplp2Q06335 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms