Protein–RNA interactions for Protein: A6PWD2

Fhad1, Forkhead-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhad1A6PWD2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC57.19■■■■■ 6.75
Fhad1A6PWD2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
Fhad1A6PWD2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.23■■■■■ 5.95
Fhad1A6PWD2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
Fhad1A6PWD2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC49.84■■■■■ 5.57
Fhad1A6PWD2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC49.65■■■■■ 5.54
Fhad1A6PWD2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
Fhad1A6PWD2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC48.75■■■■■ 5.4
Fhad1A6PWD2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
Fhad1A6PWD2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
Fhad1A6PWD2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
Fhad1A6PWD2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Fhad1A6PWD2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC47.69■■■■■ 5.22
Fhad1A6PWD2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
Fhad1A6PWD2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Fhad1A6PWD2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
Fhad1A6PWD2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
Fhad1A6PWD2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
Fhad1A6PWD2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Fhad1A6PWD2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Fhad1A6PWD2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Fhad1A6PWD2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC46.16■■■■■ 4.98
Fhad1A6PWD2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
Fhad1A6PWD2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Fhad1A6PWD2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Fhad1A6PWD2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Fhad1A6PWD2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Fhad1A6PWD2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45.81■■■■■ 4.92
Fhad1A6PWD2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.92
Fhad1A6PWD2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
Fhad1A6PWD2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Fhad1A6PWD2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Fhad1A6PWD2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Fhad1A6PWD2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Fhad1A6PWD2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Fhad1A6PWD2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Fhad1A6PWD2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
Fhad1A6PWD2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Fhad1A6PWD2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Fhad1A6PWD2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
Fhad1A6PWD2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Fhad1A6PWD2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Fhad1A6PWD2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Fhad1A6PWD2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Fhad1A6PWD2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Fhad1A6PWD2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Fhad1A6PWD2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
Fhad1A6PWD2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Fhad1A6PWD2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Fhad1A6PWD2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Fhad1A6PWD2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Fhad1A6PWD2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Fhad1A6PWD2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
Fhad1A6PWD2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Fhad1A6PWD2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
Fhad1A6PWD2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Fhad1A6PWD2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
Fhad1A6PWD2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Fhad1A6PWD2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Fhad1A6PWD2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Fhad1A6PWD2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Fhad1A6PWD2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Fhad1A6PWD2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Fhad1A6PWD2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
Fhad1A6PWD2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
Fhad1A6PWD2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Fhad1A6PWD2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Fhad1A6PWD2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
Fhad1A6PWD2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Fhad1A6PWD2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Fhad1A6PWD2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Fhad1A6PWD2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Fhad1A6PWD2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
Fhad1A6PWD2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Fhad1A6PWD2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Fhad1A6PWD2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Fhad1A6PWD2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Fhad1A6PWD2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Fhad1A6PWD2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Fhad1A6PWD2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Fhad1A6PWD2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
Fhad1A6PWD2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Fhad1A6PWD2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Fhad1A6PWD2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
Fhad1A6PWD2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Fhad1A6PWD2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
Fhad1A6PWD2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Fhad1A6PWD2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42.38■■■■■ 4.38
Fhad1A6PWD2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Fhad1A6PWD2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Fhad1A6PWD2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Fhad1A6PWD2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Fhad1A6PWD2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Fhad1A6PWD2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Fhad1A6PWD2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Fhad1A6PWD2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Fhad1A6PWD2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Fhad1A6PWD2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Fhad1A6PWD2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Fhad1A6PWD2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms