RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174831.7

Ptprd-220, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ptprd, Length 4,518 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rhox8Q6VSS7 320 aa12.41□□□□□ -0.42
Ptprd-220ENSMUST00000174831 NischQ80TM9 1593 aa12.38□□□□□ -0.43
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Abcc9P70170 1546 aa11.86□□□□□ -0.51
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa11.64□□□□□ -0.55
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Abcc8B2RUS7 1588 aa11.62□□□□□ -0.55
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Trim41Q5NCC3 630 aa11.27□□□□□ -0.61
Ptprd-220ENSMUST00000174831 NacadQ5SWP3 1504 aa11.21□□□□□ -0.61
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa11.13□□□□□ -0.63
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cngb1E1AZ71 1325 aa11.05□□□□□ -0.64
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Zeb1Q64318 1117 aa10.97□□□□□ -0.65
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa10.87□□□□□ -0.67
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Dcaf1Q80TR8 1506 aa10.86□□□□□ -0.67
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ercc6F8VPZ5 1481 aa10.86□□□□□ -0.67
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Kdm5dQ62240 1548 aa10.84□□□□□ -0.67
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Npm2Q80W85 207 aa10.83□□□□□ -0.68
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ubl4bQ9CQ84 188 aa10.81□□□□□ -0.68
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Il27Q8K3I6 234 aa10.79□□□□□ -0.68
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Sycp2Q9CUU3 1500 aa10.73□□□□□ -0.69
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Baz1aO88379 1555 aa10.66□□□□□ -0.7
Ptprd-220ENSMUST00000174831 ScribQ80U72 1612 aa10.65□□□□□ -0.7
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Crybg2B7ZCC2 1516 aa10.55□□□□□ -0.72
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rtl1Q7M732 1744 aa10.5□□□□□ -0.73
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Myt1lP97500 1187 aa10.49□□□□□ -0.73
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gab3Q8BSM5 595 aa10.49□□□□□ -0.73
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa10.48□□□□□ -0.73
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cep164Q5DU05 1446 aa10.41□□□□□ -0.74
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Kif15Q6P9L6 1387 aa10.41□□□□□ -0.74
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ccdc18Q640L5 1455 aa10.37□□□□□ -0.75
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ube2uB1AUC4 352 aa10.33□□□□□ -0.76
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ccdc180J3QNE4 1664 aa10.32□□□□□ -0.76
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
Ptprd-220ENSMUST00000174831 HrcG5E8J6 738 aa10.29□□□□□ -0.76
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Smarca2Q6DIC0 1577 aa10.29□□□□□ -0.76
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Baz1bQ9Z277 1479 aa10.25□□□□□ -0.77
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa10.18□□□□□ -0.78
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cux2P70298 1426 aa10.18□□□□□ -0.78
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa10.17□□□□□ -0.78
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Golga3P55937 1487 aa10.14□□□□□ -0.79
Ptprd-220ENSMUST00000174831 CftrP26361 1476 aa10.12□□□□□ -0.79
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Mrc2Q64449 1479 aa10.12□□□□□ -0.79
Ptprd-220ENSMUST00000174831 BicraF8VPZ9 1578 aa10.07□□□□□ -0.8
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gm13697A2AK42 830 aa10.07□□□□□ -0.8
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa10.05□□□□□ -0.8
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa10.05□□□□□ -0.8
Ptprd-220ENSMUST00000174831 NclP09405 707 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa10□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa10□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa10□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa10□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Fmn1Q05860 1466 aa9.99□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Arhgap27A2AB59 869 aa9.99□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Plppr3Q7TPB0 716 aa9.98□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Frmpd1A2AKB4 1549 aa9.96□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa9.96□□□□□ -0.81
Ptprd-220ENSMUST00000174831 AknaQ80VW7 1404 aa9.95□□□□□ -0.82
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Wdr62Q3U3T8 1523 aa9.94□□□□□ -0.82
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Synj1Q8CHC4 1574 aa9.92□□□□□ -0.82
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Fam135aQ6NS59 1506 aa9.87□□□□□ -0.83
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Lmod2Q3UHZ5 550 aa9.86□□□□□ -0.83
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Clip1Q922J3 1391 aa9.85□□□□□ -0.83
Ptprd-220ENSMUST00000174831 UbtfP25976 765 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Ift140E9PY46 1464 aa9.84□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Chic1Q8CBW7 227 aa9.83□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Gm13695A2AK44 830 aa9.82□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Clstn2Q9ER65 966 aa9.82□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Os9Q8K2C7 672 aa9.81□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa9.8□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Fgd6Q69ZL1 1399 aa9.8□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rsph4aQ8BYM7 716 aa9.8□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa9.8□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Efcab5A0JP43 1406 aa9.79□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Soga1E1U8D0 1418 aa9.79□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Setd5Q5XJV7 1441 aa9.76□□□□□ -0.85
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Arid3cA6PWV5 409 aa9.75□□□□□ -0.85
Ptprd-220ENSMUST00000174831 MyclP10166 368 aa9.75□□□□□ -0.85
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Rpap1Q80TE0 1409 aa9.74□□□□□ -0.85
Ptprd-220ENSMUST00000174831 Carmil1Q6EDY6 1374 aa9.74□□□□□ -0.85
Ptprd-220ENSMUST00000174831 CadpsQ80TJ1 1355 aa9.73□□□□□ -0.85
Ptprd-220ENSMUST00000174831 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 67.8 ms