Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51.25■■■■■ 5.79
ClspnQ80YR7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
ClspnQ80YR7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
ClspnQ80YR7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
ClspnQ80YR7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
ClspnQ80YR7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
ClspnQ80YR7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.27■■■■■ 5
ClspnQ80YR7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
ClspnQ80YR7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
ClspnQ80YR7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ClspnQ80YR7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
ClspnQ80YR7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
ClspnQ80YR7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
ClspnQ80YR7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ClspnQ80YR7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
ClspnQ80YR7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
ClspnQ80YR7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
ClspnQ80YR7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ClspnQ80YR7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
ClspnQ80YR7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ClspnQ80YR7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ClspnQ80YR7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
ClspnQ80YR7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ClspnQ80YR7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ClspnQ80YR7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ClspnQ80YR7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
ClspnQ80YR7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
ClspnQ80YR7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
ClspnQ80YR7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ClspnQ80YR7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ClspnQ80YR7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ClspnQ80YR7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
ClspnQ80YR7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ClspnQ80YR7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
ClspnQ80YR7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ClspnQ80YR7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
ClspnQ80YR7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
ClspnQ80YR7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ClspnQ80YR7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
ClspnQ80YR7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ClspnQ80YR7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ClspnQ80YR7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
ClspnQ80YR7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ClspnQ80YR7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ClspnQ80YR7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
ClspnQ80YR7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ClspnQ80YR7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ClspnQ80YR7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ClspnQ80YR7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
ClspnQ80YR7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ClspnQ80YR7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ClspnQ80YR7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ClspnQ80YR7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ClspnQ80YR7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
ClspnQ80YR7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ClspnQ80YR7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ClspnQ80YR7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ClspnQ80YR7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ClspnQ80YR7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ClspnQ80YR7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ClspnQ80YR7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ClspnQ80YR7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ClspnQ80YR7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ClspnQ80YR7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ClspnQ80YR7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ClspnQ80YR7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ClspnQ80YR7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ClspnQ80YR7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
ClspnQ80YR7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ClspnQ80YR7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ClspnQ80YR7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ClspnQ80YR7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ClspnQ80YR7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ClspnQ80YR7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
ClspnQ80YR7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ClspnQ80YR7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ClspnQ80YR7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ClspnQ80YR7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
ClspnQ80YR7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ClspnQ80YR7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ClspnQ80YR7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ClspnQ80YR7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ClspnQ80YR7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ClspnQ80YR7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ClspnQ80YR7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
ClspnQ80YR7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ClspnQ80YR7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
ClspnQ80YR7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
ClspnQ80YR7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
ClspnQ80YR7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ClspnQ80YR7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ClspnQ80YR7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ClspnQ80YR7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ClspnQ80YR7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
ClspnQ80YR7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ClspnQ80YR7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ClspnQ80YR7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ClspnQ80YR7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ClspnQ80YR7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
ClspnQ80YR7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms