Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2G5

Synj2, Synaptojanin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synj2Q9D2G5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC60.43■■■■■ 7.26
Synj2Q9D2G5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC56.31■■■■■ 6.6
Synj2Q9D2G5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.29■■■■■ 6.44
Synj2Q9D2G5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52.84■■■■■ 6.05
Synj2Q9D2G5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52.05■■■■■ 5.92
Synj2Q9D2G5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
Synj2Q9D2G5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
Synj2Q9D2G5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC50.83■■■■■ 5.73
Synj2Q9D2G5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
Synj2Q9D2G5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
Synj2Q9D2G5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC50.35■■■■■ 5.65
Synj2Q9D2G5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.47■■■■■ 5.51
Synj2Q9D2G5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Synj2Q9D2G5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.04■■■■■ 5.44
Synj2Q9D2G5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48.96■■■■■ 5.43
Synj2Q9D2G5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
Synj2Q9D2G5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
Synj2Q9D2G5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
Synj2Q9D2G5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48.1■■■■■ 5.29
Synj2Q9D2G5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
Synj2Q9D2G5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Synj2Q9D2G5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47.95■■■■■ 5.27
Synj2Q9D2G5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.11■■■■■ 5.13
Synj2Q9D2G5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Synj2Q9D2G5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
Synj2Q9D2G5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
Synj2Q9D2G5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Synj2Q9D2G5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
Synj2Q9D2G5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC46.39■■■■■ 5.02
Synj2Q9D2G5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
Synj2Q9D2G5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC46.29■■■■■ 5
Synj2Q9D2G5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Synj2Q9D2G5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46.24■■■■■ 4.99
Synj2Q9D2G5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
Synj2Q9D2G5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
Synj2Q9D2G5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Synj2Q9D2G5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Synj2Q9D2G5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Synj2Q9D2G5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
Synj2Q9D2G5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Synj2Q9D2G5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
Synj2Q9D2G5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
Synj2Q9D2G5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
Synj2Q9D2G5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
Synj2Q9D2G5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Synj2Q9D2G5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45.44■■■■■ 4.87
Synj2Q9D2G5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.87
Synj2Q9D2G5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Synj2Q9D2G5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
Synj2Q9D2G5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Synj2Q9D2G5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
Synj2Q9D2G5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Synj2Q9D2G5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Synj2Q9D2G5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Synj2Q9D2G5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Synj2Q9D2G5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Synj2Q9D2G5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Synj2Q9D2G5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
Synj2Q9D2G5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Synj2Q9D2G5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Synj2Q9D2G5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
Synj2Q9D2G5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Synj2Q9D2G5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Synj2Q9D2G5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Synj2Q9D2G5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Synj2Q9D2G5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Synj2Q9D2G5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Synj2Q9D2G5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Synj2Q9D2G5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Synj2Q9D2G5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Synj2Q9D2G5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
Synj2Q9D2G5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
Synj2Q9D2G5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Synj2Q9D2G5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Synj2Q9D2G5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Synj2Q9D2G5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Synj2Q9D2G5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Synj2Q9D2G5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Synj2Q9D2G5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Synj2Q9D2G5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Synj2Q9D2G5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Synj2Q9D2G5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Synj2Q9D2G5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Synj2Q9D2G5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Synj2Q9D2G5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Synj2Q9D2G5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Synj2Q9D2G5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
Synj2Q9D2G5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Synj2Q9D2G5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
Synj2Q9D2G5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Synj2Q9D2G5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Synj2Q9D2G5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Synj2Q9D2G5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Synj2Q9D2G5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43■■■■■ 4.47
Synj2Q9D2G5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Synj2Q9D2G5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Synj2Q9D2G5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Synj2Q9D2G5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
Synj2Q9D2G5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Synj2Q9D2G5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms