Protein–RNA interactions for Protein: O54824

Il16, Pro-interleukin-16, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il16O54824 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC57,98■■■■■ 6,87
Il16O54824 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC53,62■■■■■ 6,17
Il16O54824 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,81■■■■■ 6,04
Il16O54824 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC50,63■■■■■ 5,7
Il16O54824 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC50,36■■■■■ 5,65
Il16O54824 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC49,62■■■■■ 5,53
Il16O54824 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,34■■■■■ 5,49
Il16O54824 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,02■■■■■ 5,44
Il16O54824 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5,43
Il16O54824 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,58■■■■■ 5,37
Il16O54824 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48,51■■■■■ 5,36
Il16O54824 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC48,38■■■■■ 5,34
Il16O54824 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,18■■■■■ 5,3
Il16O54824 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,81■■■■■ 5,24
Il16O54824 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,29■■■■■ 5,16
Il16O54824 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46,82■■■■■ 5,09
Il16O54824 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,81■■■■■ 5,08
Il16O54824 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC46,75■■■■■ 5,07
Il16O54824 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46,69■■■■■ 5,07
Il16O54824 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,63■■■■■ 5,06
Il16O54824 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC46,55■■■■■ 5,04
Il16O54824 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,41■■■■■ 5,02
Il16O54824 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46,29■■■■■ 5
Il16O54824 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,2■■■■■ 4,99
Il16O54824 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,12■■■■■ 4,97
Il16O54824 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,05■■■■■ 4,96
Il16O54824 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,99■■■■■ 4,95
Il16O54824 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,96■■■■■ 4,95
Il16O54824 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45,94■■■■■ 4,94
Il16O54824 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,9■■■■■ 4,94
Il16O54824 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45,87■■■■■ 4,93
Il16O54824 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC45,81■■■■■ 4,92
Il16O54824 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC45,71■■■■■ 4,91
Il16O54824 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,61■■■■■ 4,89
Il16O54824 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,57■■■■■ 4,89
Il16O54824 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45,37■■■■■ 4,85
Il16O54824 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,3■■■■■ 4,84
Il16O54824 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44,98■■■■■ 4,79
Il16O54824 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44,89■■■■■ 4,78
Il16O54824 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC44,64■■■■■ 4,74
Il16O54824 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,64■■■■■ 4,74
Il16O54824 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC44,51■■■■■ 4,72
Il16O54824 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC44,44■■■■■ 4,7
Il16O54824 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC44,42■■■■■ 4,7
Il16O54824 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44,42■■■■■ 4,7
Il16O54824 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,36■■■■■ 4,69
Il16O54824 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,3■■■■■ 4,68
Il16O54824 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,25■■■■■ 4,67
Il16O54824 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,09■■■■■ 4,65
Il16O54824 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44,08■■■■■ 4,65
Il16O54824 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC44,04■■■■■ 4,64
Il16O54824 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43,79■■■■■ 4,6
Il16O54824 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,77■■■■■ 4,6
Il16O54824 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,72■■■■■ 4,59
Il16O54824 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43,7■■■■■ 4,59
Il16O54824 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43,65■■■■■ 4,58
Il16O54824 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,63■■■■■ 4,58
Il16O54824 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,63■■■■■ 4,57
Il16O54824 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC43,61■■■■■ 4,57
Il16O54824 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC43,44■■■■■ 4,54
Il16O54824 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,39■■■■■ 4,54
Il16O54824 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,31■■■■■ 4,52
Il16O54824 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,28■■■■■ 4,52
Il16O54824 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC43,25■■■■■ 4,51
Il16O54824 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43,23■■■■■ 4,51
Il16O54824 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC43,19■■■■■ 4,5
Il16O54824 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43,15■■■■■ 4,5
Il16O54824 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43,13■■■■■ 4,49
Il16O54824 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC43,08■■■■■ 4,49
Il16O54824 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,07■■■■■ 4,48
Il16O54824 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Il16O54824 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,98■■■■■ 4,47
Il16O54824 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Il16O54824 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,94■■■■■ 4,47
Il16O54824 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42,94■■■■■ 4,46
Il16O54824 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,93■■■■■ 4,46
Il16O54824 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42,9■■■■■ 4,46
Il16O54824 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Il16O54824 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Il16O54824 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,78■■■■■ 4,44
Il16O54824 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42,71■■■■■ 4,43
Il16O54824 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,7■■■■■ 4,43
Il16O54824 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,68■■■■■ 4,42
Il16O54824 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42,63■■■■■ 4,41
Il16O54824 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,41
Il16O54824 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42,62■■■■■ 4,41
Il16O54824 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,61■■■■■ 4,41
Il16O54824 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Il16O54824 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,53■■■■■ 4,4
Il16O54824 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42,49■■■■■ 4,39
Il16O54824 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,47■■■■■ 4,39
Il16O54824 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC42,47■■■■■ 4,39
Il16O54824 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,4■■■■■ 4,38
Il16O54824 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,38■■■■■ 4,38
Il16O54824 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,33■■■■■ 4,37
Il16O54824 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42,32■■■■■ 4,36
Il16O54824 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42,28■■■■■ 4,36
Il16O54824 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42,27■■■■■ 4,36
Il16O54824 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC42,23■■■■■ 4,35
Il16O54824 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42,18■■■■■ 4,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms