Protein–RNA interactions for Protein: Q80TH2

Erbin, Erbin, mousemouse

Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErbinQ80TH2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC56.17■■■■■ 6.58
ErbinQ80TH2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
ErbinQ80TH2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
ErbinQ80TH2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
ErbinQ80TH2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.82■■■■■ 5.41
ErbinQ80TH2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47.88■■■■■ 5.25
ErbinQ80TH2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
ErbinQ80TH2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
ErbinQ80TH2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
ErbinQ80TH2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
ErbinQ80TH2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46.86■■■■■ 5.09
ErbinQ80TH2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
ErbinQ80TH2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
ErbinQ80TH2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
ErbinQ80TH2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
ErbinQ80TH2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
ErbinQ80TH2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45.2■■■■■ 4.83
ErbinQ80TH2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ErbinQ80TH2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
ErbinQ80TH2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ErbinQ80TH2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ErbinQ80TH2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ErbinQ80TH2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
ErbinQ80TH2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
ErbinQ80TH2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
ErbinQ80TH2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
ErbinQ80TH2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
ErbinQ80TH2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
ErbinQ80TH2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ErbinQ80TH2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
ErbinQ80TH2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
ErbinQ80TH2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
ErbinQ80TH2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
ErbinQ80TH2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
ErbinQ80TH2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
ErbinQ80TH2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
ErbinQ80TH2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ErbinQ80TH2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ErbinQ80TH2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ErbinQ80TH2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
ErbinQ80TH2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ErbinQ80TH2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
ErbinQ80TH2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ErbinQ80TH2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ErbinQ80TH2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
ErbinQ80TH2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ErbinQ80TH2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
ErbinQ80TH2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
ErbinQ80TH2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ErbinQ80TH2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ErbinQ80TH2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ErbinQ80TH2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
ErbinQ80TH2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ErbinQ80TH2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
ErbinQ80TH2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ErbinQ80TH2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ErbinQ80TH2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ErbinQ80TH2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
ErbinQ80TH2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ErbinQ80TH2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ErbinQ80TH2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
ErbinQ80TH2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ErbinQ80TH2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ErbinQ80TH2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ErbinQ80TH2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
ErbinQ80TH2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ErbinQ80TH2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
ErbinQ80TH2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ErbinQ80TH2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
ErbinQ80TH2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ErbinQ80TH2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
ErbinQ80TH2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ErbinQ80TH2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ErbinQ80TH2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ErbinQ80TH2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
ErbinQ80TH2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ErbinQ80TH2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ErbinQ80TH2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ErbinQ80TH2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ErbinQ80TH2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ErbinQ80TH2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ErbinQ80TH2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ErbinQ80TH2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ErbinQ80TH2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ErbinQ80TH2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ErbinQ80TH2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ErbinQ80TH2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ErbinQ80TH2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
ErbinQ80TH2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ErbinQ80TH2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ErbinQ80TH2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ErbinQ80TH2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ErbinQ80TH2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ErbinQ80TH2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ErbinQ80TH2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ErbinQ80TH2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
ErbinQ80TH2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
ErbinQ80TH2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ErbinQ80TH2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ErbinQ80TH2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms