Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY96

Cfap74, Cilia- and flagella-associated protein 74, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap74Q3UY96 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC59.58■■■■■ 7.13
Cfap74Q3UY96 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55.33■■■■■ 6.45
Cfap74Q3UY96 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.28■■■■■ 6.28
Cfap74Q3UY96 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC51.95■■■■■ 5.91
Cfap74Q3UY96 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC51.82■■■■■ 5.89
Cfap74Q3UY96 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC50.75■■■■■ 5.71
Cfap74Q3UY96 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
Cfap74Q3UY96 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
Cfap74Q3UY96 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
Cfap74Q3UY96 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC49.7■■■■■ 5.55
Cfap74Q3UY96 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
Cfap74Q3UY96 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.87■■■■■ 5.41
Cfap74Q3UY96 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC48.37■■■■■ 5.33
Cfap74Q3UY96 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
Cfap74Q3UY96 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
Cfap74Q3UY96 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48■■■■■ 5.28
Cfap74Q3UY96 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.26
Cfap74Q3UY96 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Cfap74Q3UY96 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC47.68■■■■■ 5.22
Cfap74Q3UY96 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Cfap74Q3UY96 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
Cfap74Q3UY96 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
Cfap74Q3UY96 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
Cfap74Q3UY96 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
Cfap74Q3UY96 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
Cfap74Q3UY96 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47.1■■■■■ 5.13
Cfap74Q3UY96 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
Cfap74Q3UY96 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
Cfap74Q3UY96 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Cfap74Q3UY96 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Cfap74Q3UY96 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Cfap74Q3UY96 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
Cfap74Q3UY96 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
Cfap74Q3UY96 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
Cfap74Q3UY96 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Cfap74Q3UY96 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
Cfap74Q3UY96 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Cfap74Q3UY96 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC45.78■■■■■ 4.92
Cfap74Q3UY96 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45.67■■■■■ 4.9
Cfap74Q3UY96 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Cfap74Q3UY96 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Cfap74Q3UY96 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Cfap74Q3UY96 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
Cfap74Q3UY96 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
Cfap74Q3UY96 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Cfap74Q3UY96 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
Cfap74Q3UY96 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Cfap74Q3UY96 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Cfap74Q3UY96 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
Cfap74Q3UY96 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
Cfap74Q3UY96 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
Cfap74Q3UY96 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Cfap74Q3UY96 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Cfap74Q3UY96 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Cfap74Q3UY96 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Cfap74Q3UY96 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Cfap74Q3UY96 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Cfap74Q3UY96 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Cfap74Q3UY96 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Cfap74Q3UY96 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Cfap74Q3UY96 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
Cfap74Q3UY96 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Cfap74Q3UY96 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
Cfap74Q3UY96 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Cfap74Q3UY96 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Cfap74Q3UY96 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Cfap74Q3UY96 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Cfap74Q3UY96 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
Cfap74Q3UY96 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Cfap74Q3UY96 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Cfap74Q3UY96 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Cfap74Q3UY96 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Cfap74Q3UY96 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Cfap74Q3UY96 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Cfap74Q3UY96 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Cfap74Q3UY96 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
Cfap74Q3UY96 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Cfap74Q3UY96 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Cfap74Q3UY96 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Cfap74Q3UY96 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Cfap74Q3UY96 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Cfap74Q3UY96 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Cfap74Q3UY96 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
Cfap74Q3UY96 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
Cfap74Q3UY96 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Cfap74Q3UY96 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Cfap74Q3UY96 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Cfap74Q3UY96 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Cfap74Q3UY96 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Cfap74Q3UY96 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Cfap74Q3UY96 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Cfap74Q3UY96 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Cfap74Q3UY96 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
Cfap74Q3UY96 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Cfap74Q3UY96 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Cfap74Q3UY96 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Cfap74Q3UY96 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Cfap74Q3UY96 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Cfap74Q3UY96 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Cfap74Q3UY96 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms