Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVE8

Nsd2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, mousemouse

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd2Q8BVE8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC56,75■■■■■ 6,68
Nsd2Q8BVE8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52,55■■■■■ 6
Nsd2Q8BVE8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,72■■■■■ 5,87
Nsd2Q8BVE8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC49,53■■■■■ 5,52
Nsd2Q8BVE8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC49,3■■■■■ 5,48
Nsd2Q8BVE8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC48,46■■■■■ 5,35
Nsd2Q8BVE8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,99■■■■■ 5,27
Nsd2Q8BVE8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,94■■■■■ 5,26
Nsd2Q8BVE8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,7■■■■■ 5,23
Nsd2Q8BVE8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47,62■■■■■ 5,21
Nsd2Q8BVE8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC47,39■■■■■ 5,18
Nsd2Q8BVE8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,17■■■■■ 5,14
Nsd2Q8BVE8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,01■■■■■ 5,12
Nsd2Q8BVE8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,2■■■■■ 4,99
Nsd2Q8BVE8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,15■■■■■ 4,98
Nsd2Q8BVE8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45,9■■■■■ 4,94
Nsd2Q8BVE8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45,66■■■■■ 4,9
Nsd2Q8BVE8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45,61■■■■■ 4,89
Nsd2Q8BVE8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45,45■■■■■ 4,87
Nsd2Q8BVE8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,41■■■■■ 4,86
Nsd2Q8BVE8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,39■■■■■ 4,86
Nsd2Q8BVE8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC45,34■■■■■ 4,85
Nsd2Q8BVE8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,33■■■■■ 4,85
Nsd2Q8BVE8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,14■■■■■ 4,82
Nsd2Q8BVE8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,01■■■■■ 4,8
Nsd2Q8BVE8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,99■■■■■ 4,79
Nsd2Q8BVE8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,88■■■■■ 4,77
Nsd2Q8BVE8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44,82■■■■■ 4,77
Nsd2Q8BVE8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44,82■■■■■ 4,76
Nsd2Q8BVE8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,79■■■■■ 4,76
Nsd2Q8BVE8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,73■■■■■ 4,75
Nsd2Q8BVE8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44,73■■■■■ 4,75
Nsd2Q8BVE8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44,56■■■■■ 4,72
Nsd2Q8BVE8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,46■■■■■ 4,71
Nsd2Q8BVE8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,13■■■■■ 4,66
Nsd2Q8BVE8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44,06■■■■■ 4,64
Nsd2Q8BVE8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,95■■■■■ 4,63
Nsd2Q8BVE8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43,74■■■■■ 4,59
Nsd2Q8BVE8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC43,68■■■■■ 4,58
Nsd2Q8BVE8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43,68■■■■■ 4,58
Nsd2Q8BVE8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,6■■■■■ 4,57
Nsd2Q8BVE8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC43,59■■■■■ 4,57
Nsd2Q8BVE8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,5■■■■■ 4,55
Nsd2Q8BVE8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC43,49■■■■■ 4,55
Nsd2Q8BVE8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43,36■■■■■ 4,53
Nsd2Q8BVE8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
Nsd2Q8BVE8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC43,1■■■■■ 4,49
Nsd2Q8BVE8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Nsd2Q8BVE8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42,96■■■■■ 4,47
Nsd2Q8BVE8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC42,82■■■■■ 4,45
Nsd2Q8BVE8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,8■■■■■ 4,44
Nsd2Q8BVE8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
Nsd2Q8BVE8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC42,67■■■■■ 4,42
Nsd2Q8BVE8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Nsd2Q8BVE8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,58■■■■■ 4,41
Nsd2Q8BVE8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42,56■■■■■ 4,4
Nsd2Q8BVE8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC42,52■■■■■ 4,4
Nsd2Q8BVE8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42,43■■■■■ 4,38
Nsd2Q8BVE8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42,42■■■■■ 4,38
Nsd2Q8BVE8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,4■■■■■ 4,38
Nsd2Q8BVE8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42,28■■■■■ 4,36
Nsd2Q8BVE8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,2■■■■■ 4,35
Nsd2Q8BVE8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42,2■■■■■ 4,35
Nsd2Q8BVE8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,2■■■■■ 4,35
Nsd2Q8BVE8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Nsd2Q8BVE8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
Nsd2Q8BVE8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42,1■■■■■ 4,33
Nsd2Q8BVE8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,07■■■■■ 4,33
Nsd2Q8BVE8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC42,06■■■■■ 4,32
Nsd2Q8BVE8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42,03■■■■■ 4,32
Nsd2Q8BVE8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,02■■■■■ 4,32
Nsd2Q8BVE8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41,94■■■■■ 4,3
Nsd2Q8BVE8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41,94■■■■■ 4,3
Nsd2Q8BVE8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,86■■■■■ 4,29
Nsd2Q8BVE8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,81■■■■■ 4,28
Nsd2Q8BVE8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,8■■■■■ 4,28
Nsd2Q8BVE8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,75■■■■■ 4,27
Nsd2Q8BVE8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Nsd2Q8BVE8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Nsd2Q8BVE8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41,72■■■■■ 4,27
Nsd2Q8BVE8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41,7■■■■■ 4,27
Nsd2Q8BVE8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41,6■■■■■ 4,25
Nsd2Q8BVE8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,58■■■■■ 4,25
Nsd2Q8BVE8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41,53■■■■■ 4,24
Nsd2Q8BVE8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,53■■■■■ 4,24
Nsd2Q8BVE8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,51■■■■■ 4,24
Nsd2Q8BVE8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Nsd2Q8BVE8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Nsd2Q8BVE8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Nsd2Q8BVE8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41,45■■■■■ 4,23
Nsd2Q8BVE8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,44■■■■■ 4,22
Nsd2Q8BVE8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Nsd2Q8BVE8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Nsd2Q8BVE8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41,29■■■■■ 4,2
Nsd2Q8BVE8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC41,25■■■■■ 4,19
Nsd2Q8BVE8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC41,23■■■■■ 4,19
Nsd2Q8BVE8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41,2■■■■■ 4,19
Nsd2Q8BVE8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,15■■■■■ 4,18
Nsd2Q8BVE8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,14■■■■■ 4,18
Nsd2Q8BVE8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms