Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61.17■■■■■ 7.38
Arap1Q4LDD4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC56.84■■■■■ 6.69
Arap1Q4LDD4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.7■■■■■ 6.51
Arap1Q4LDD4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC53.38■■■■■ 6.14
Arap1Q4LDD4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC53.1■■■■■ 6.09
Arap1Q4LDD4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.23■■■■■ 5.95
Arap1Q4LDD4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC52.01■■■■■ 5.92
Arap1Q4LDD4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
Arap1Q4LDD4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
Arap1Q4LDD4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
Arap1Q4LDD4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
Arap1Q4LDD4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
Arap1Q4LDD4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC50.97■■■■■ 5.75
Arap1Q4LDD4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.39■■■■■ 5.66
Arap1Q4LDD4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.74■■■■■ 5.55
Arap1Q4LDD4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
Arap1Q4LDD4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC49.38■■■■■ 5.5
Arap1Q4LDD4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
Arap1Q4LDD4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.23■■■■■ 5.47
Arap1Q4LDD4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
Arap1Q4LDD4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49■■■■■ 5.43
Arap1Q4LDD4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48.86■■■■■ 5.41
Arap1Q4LDD4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
Arap1Q4LDD4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
Arap1Q4LDD4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
Arap1Q4LDD4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
Arap1Q4LDD4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
Arap1Q4LDD4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48.39■■■■■ 5.34
Arap1Q4LDD4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Arap1Q4LDD4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48.34■■■■■ 5.33
Arap1Q4LDD4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Arap1Q4LDD4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
Arap1Q4LDD4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.29
Arap1Q4LDD4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC48.09■■■■■ 5.29
Arap1Q4LDD4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
Arap1Q4LDD4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.28
Arap1Q4LDD4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
Arap1Q4LDD4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.54■■■■■ 5.2
Arap1Q4LDD4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
Arap1Q4LDD4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
Arap1Q4LDD4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
Arap1Q4LDD4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC46.93■■■■■ 5.1
Arap1Q4LDD4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC46.82■■■■■ 5.09
Arap1Q4LDD4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Arap1Q4LDD4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Arap1Q4LDD4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
Arap1Q4LDD4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Arap1Q4LDD4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC46.42■■■■■ 5.02
Arap1Q4LDD4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
Arap1Q4LDD4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
Arap1Q4LDD4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Arap1Q4LDD4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
Arap1Q4LDD4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Arap1Q4LDD4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC46.14■■■■■ 4.98
Arap1Q4LDD4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Arap1Q4LDD4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Arap1Q4LDD4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
Arap1Q4LDD4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
Arap1Q4LDD4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
Arap1Q4LDD4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
Arap1Q4LDD4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Arap1Q4LDD4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45.7■■■■■ 4.91
Arap1Q4LDD4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
Arap1Q4LDD4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Arap1Q4LDD4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Arap1Q4LDD4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Arap1Q4LDD4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC45.44■■■■■ 4.87
Arap1Q4LDD4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Arap1Q4LDD4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Arap1Q4LDD4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
Arap1Q4LDD4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
Arap1Q4LDD4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
Arap1Q4LDD4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
Arap1Q4LDD4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Arap1Q4LDD4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Arap1Q4LDD4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Arap1Q4LDD4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Arap1Q4LDD4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Arap1Q4LDD4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Arap1Q4LDD4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Arap1Q4LDD4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Arap1Q4LDD4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Arap1Q4LDD4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Arap1Q4LDD4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.82■■■■■ 4.77
Arap1Q4LDD4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
Arap1Q4LDD4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
Arap1Q4LDD4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Arap1Q4LDD4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Arap1Q4LDD4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
Arap1Q4LDD4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Arap1Q4LDD4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Arap1Q4LDD4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Arap1Q4LDD4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Arap1Q4LDD4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Arap1Q4LDD4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
Arap1Q4LDD4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Arap1Q4LDD4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Arap1Q4LDD4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Arap1Q4LDD4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
Arap1Q4LDD4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms