Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC59.48■■■■■ 7.11
Caskin1Q6P9K8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55.15■■■■■ 6.42
Caskin1Q6P9K8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.19■■■■■ 6.27
Caskin1Q6P9K8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC51.79■■■■■ 5.88
Caskin1Q6P9K8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC51.79■■■■■ 5.88
Caskin1Q6P9K8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC50.72■■■■■ 5.71
Caskin1Q6P9K8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
Caskin1Q6P9K8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.62
Caskin1Q6P9K8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
Caskin1Q6P9K8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC49.62■■■■■ 5.53
Caskin1Q6P9K8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
Caskin1Q6P9K8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
Caskin1Q6P9K8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
Caskin1Q6P9K8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
Caskin1Q6P9K8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC48.2■■■■■ 5.31
Caskin1Q6P9K8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC47.87■■■■■ 5.25
Caskin1Q6P9K8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.25
Caskin1Q6P9K8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC47.73■■■■■ 5.23
Caskin1Q6P9K8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
Caskin1Q6P9K8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Caskin1Q6P9K8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Caskin1Q6P9K8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
Caskin1Q6P9K8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
Caskin1Q6P9K8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
Caskin1Q6P9K8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
Caskin1Q6P9K8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Caskin1Q6P9K8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Caskin1Q6P9K8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47.02■■■■■ 5.12
Caskin1Q6P9K8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC46.99■■■■■ 5.11
Caskin1Q6P9K8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Caskin1Q6P9K8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Caskin1Q6P9K8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Caskin1Q6P9K8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46.42■■■■■ 5.02
Caskin1Q6P9K8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
Caskin1Q6P9K8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Caskin1Q6P9K8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Caskin1Q6P9K8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Caskin1Q6P9K8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC45.73■■■■■ 4.91
Caskin1Q6P9K8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
Caskin1Q6P9K8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Caskin1Q6P9K8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45.59■■■■■ 4.89
Caskin1Q6P9K8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Caskin1Q6P9K8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
Caskin1Q6P9K8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
Caskin1Q6P9K8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
Caskin1Q6P9K8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
Caskin1Q6P9K8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45.07■■■■■ 4.81
Caskin1Q6P9K8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Caskin1Q6P9K8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Caskin1Q6P9K8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
Caskin1Q6P9K8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Caskin1Q6P9K8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
Caskin1Q6P9K8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Caskin1Q6P9K8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
Caskin1Q6P9K8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Caskin1Q6P9K8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Caskin1Q6P9K8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
Caskin1Q6P9K8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Caskin1Q6P9K8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Caskin1Q6P9K8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Caskin1Q6P9K8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Caskin1Q6P9K8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Caskin1Q6P9K8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Caskin1Q6P9K8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Caskin1Q6P9K8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
Caskin1Q6P9K8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Caskin1Q6P9K8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Caskin1Q6P9K8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Caskin1Q6P9K8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Caskin1Q6P9K8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Caskin1Q6P9K8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
Caskin1Q6P9K8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Caskin1Q6P9K8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Caskin1Q6P9K8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Caskin1Q6P9K8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Caskin1Q6P9K8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Caskin1Q6P9K8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Caskin1Q6P9K8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Caskin1Q6P9K8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Caskin1Q6P9K8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Caskin1Q6P9K8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Caskin1Q6P9K8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Caskin1Q6P9K8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Caskin1Q6P9K8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Caskin1Q6P9K8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Caskin1Q6P9K8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Caskin1Q6P9K8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Caskin1Q6P9K8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
Caskin1Q6P9K8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Caskin1Q6P9K8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Caskin1Q6P9K8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Caskin1Q6P9K8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Caskin1Q6P9K8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Caskin1Q6P9K8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Caskin1Q6P9K8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Caskin1Q6P9K8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Caskin1Q6P9K8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Caskin1Q6P9K8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Caskin1Q6P9K8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Caskin1Q6P9K8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms