RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
MRP4	YHL004W	ASI2	P53895	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	MCP2	Q06567	569 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	SIL1	Q08199	421 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YLR462W	O13556	202 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	CDC8	P00572	216 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	RRT12	P25381	491 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	FUB1	P25659	250 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.35	□□□□□ -1.71	not detected
MRP4	YHL004W	PRR1	P28708	518 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	PPQ1	P32945	549 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	LTV1	P34078	463 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YMC2	P38087	329 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	SIF2	P38262	535 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	RRT2	P38332	387 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	HIS2	P38635	335 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YHL049C	P38722	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YEL075C	P39972	122 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YER189W	P40104	122 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	OSW5	P40219	148 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YFL064C	P43540	174 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	TCB2	P48231	1178 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	IMA1	P53051	589 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	MNT2	P53059	558 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	COG1	P53079	417 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	RAD30	Q04049	632 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	ECI1	Q05871	280 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	ATG23	Q06671	453 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	AAD4	Q07747	329 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	NUS1	Q12063	375 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	NMD4	Q12129	218 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	HER1	Q12276	1246 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	GPM3	Q12326	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	ECM3	Q99252	613 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	JIP3	O13555	125 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	COX4	P04037	155 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YCK1	P23291	538 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YCR051W	P25631	222 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YUH1	P35127	236 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	SRO77	P38163	1010 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	COS111	P38308	924 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	HSM3	P38348	480 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YHR033W	P38690	423 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	PCL5	P38794	229 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	WSS1	P38838	269 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	REV7	P38927	245 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	AFG3	P39925	761 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YER186C	P40101	306 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	GCD10	P41814	478 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	SIP4	P46954	829 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YJL163C	P46996	555 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YJR054W	P47114	497 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	MND1	P53102	219 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	FMP30	Q02883	468 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	RCO1	Q04779	684 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	ENT4	Q07872	247 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	CIR2	Q08822	631 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	CTF3	Q12748	733 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	AFI1	Q99222	893 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MRP4	YHL004W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
MRP4	YHL004W	STE12	P13574	688 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MRP4	YHL004W	APE1	P14904	514 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MRP4	YHL004W	PUT4	P15380	627 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MRP4	YHL004W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
MRP4	YHL004W	CPR2	P23285	205 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MRP4	YHL004W	VPS3	P23643	1011 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MRP4	YHL004W	POL4	P25615	582 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MRP4	YHL004W	MRP20	P32387	263 aa		4.33	□□□□□ -1.72
MRP4	YHL004W	MRP4	P32902	394 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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