RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	GLO2	Q05584	274 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	IZH3	Q07959	543 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	DAS2	Q12084	232 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	HUA2	Q12134	243 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RTR2	Q12378	196 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	USO1	P25386	1790 aa		3.4	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RPN13	O13563	156 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.4	□□□□□ -1.87	not detected
ECO1	YFR027W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HMG2	P12684	1045 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	STE12	P13574	688 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YAK1	P14680	807 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CDC26	P14724	124 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SPO11	P23179	398 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CLB3	P24870	427 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PRE4	P30657	266 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GYP6	P32806	458 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MYO3	P36006	1272 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ETR1	P38071	380 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DUN1	P39009	513 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YEL020C	P39994	560 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RTT105	P40063	208 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DDI1	P40087	428 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ATF1	P40353	525 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	FMP32	P43557	207 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YGL108C	P53139	140 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HER2	Q03557	464 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.4	□□□□□ -1.87	not detected
ECO1	YFR027W	AIM41	Q12032	185 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RIM20	Q12033	661 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RKI1	Q12189	258 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ATG34	Q12292	412 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YOR111W	Q99210	232 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY2B-C	P25384	1770 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ATR1	P13090	542 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ALG1	P16661	449 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HXT2	P23585	541 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PTP1	P25044	335 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ACH1	P32316	526 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GRX4	P32642	244 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	APL3	P38065	1025 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ECM31	P38122	312 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MUP3	P38734	546 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YHI9	P38765	294 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CTM1	P38818	585 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	VMA7	P39111	118 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MIT1	P40002	666 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	AGE2	P40529	298 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PRM2	P40534	656 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	IRC5	P43610	853 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GLG2	P47011	380 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SNF12	P53628	566 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ZRG17	P53735	605 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GOR1	P53839	350 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RAD30	Q04049	632 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	UFO1	Q04511	668 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ARP9	Q05123	467 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YPD1	Q07688	167 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	LOT6	Q07923	191 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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