RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	ACL4	Q03771	387 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PPM1	Q04081	328 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	CRF1	Q04930	467 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	BOP2	Q06150	570 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	LDB17	Q12342	491 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YSP3	P25036	478 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SRB5	P32585	307 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	AKR1	P39010	764 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YGR012W	P53206	393 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	IMO32	P53219	342 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.26	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	USO1	P25386	1790 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	STE3	P06783	470 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PRD1	P25375	712 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	GEX1	P25596	615 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PXL1	P36166	706 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PFF1	P38244	976 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MSS4	P38994	779 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YJL070C	P40361	888 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SEG1	Q04279	960 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	ECM7	Q06200	448 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MDM36	Q06820	579 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RTT109	Q07794	436 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MRPL4	P36517	319 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	TAT1	P38085	619 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SWP82	P43554	623 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	TOM22	P49334	152 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	HST3	P53687	447 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MCM21	Q06675	368 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SGO1	Q08490	590 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RBD2	Q12270	262 aa		4.25	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	IML1	P47170	1584 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.24	□□□□□ -1.73	not detected
STV1	YMR054W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YIH1	P25637	258 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	WSS1	P38838	269 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YTA12	P40341	825 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	CTR1	P49573	406 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	VID30	P53076	958 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MRPS35	P53292	345 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	BOP3	P53958	396 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YVC1	Q12324	675 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	CBP1	P07252	654 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	ELO2	P25358	347 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	DCG1	P32460	244 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PHO11	P35842	467 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	PHO12	P38693	467 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	SSO2	P39926	295 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YGL185C	P53100	379 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YGL138C	P53122	345 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	TIM21	P53220	239 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	REC102	Q02721	264 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	USA1	Q03714	838 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	HOF1	Q05080	669 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	POM34	Q12445	299 aa		4.24	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	VMR1	P38735	1592 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MRP13	P12686	339 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	TOS1	P38288	455 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MSG5	P38590	489 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YHL012W	P38709	493 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	GIP4	P39732	760 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	YJL132W	P47014	750 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	VTA1	Q06263	330 aa		4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
STV1	YMR054W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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