Protein–RNA interactions for Protein: P53100

YGL185C, Putative 2-hydroxyacid dehydrogenase YGL185C, yeastyeast

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGL185CP53100 NSR1YGR159C 1245 nt15.67■□□□□ 0.1
YGL185CP53100 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.42■□□□□ 0.06
YGL185CP53100 NOP1YDL014W 984 nt14.89□□□□□ -0.03
YGL185CP53100 MDJ1YFL016C 1536 nt14.41□□□□□ -0.1
YGL185CP53100 SSA3YBL075C 1950 nt13.37□□□□□ -0.27
YGL185CP53100 YKL036CYKL036C 393 nt13.29□□□□□ -0.28
YGL185CP53100 YJL027CYJL027C 417 nt13.19□□□□□ -0.3
YGL185CP53100 SRX1YKL086W 384 nt12.92□□□□□ -0.34
YGL185CP53100 Q0297Q0297 156 nt12.8□□□□□ -0.36
YGL185CP53100 YBR190WYBR190W 312 nt12.47□□□□□ -0.41
YGL185CP53100 DBP2YNL112W 1641 nt12.4□□□□□ -0.42
YGL185CP53100 YCR051WYCR051W 669 nt12.28□□□□□ -0.44
YGL185CP53100 RTC3YHR087W 336 nt12.12□□□□□ -0.47
YGL185CP53100 PUT4YOR348C 1884 nt12.02□□□□□ -0.49
YGL185CP53100 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.89□□□□□ -0.51
YGL185CP53100 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.89□□□□□ -0.51
YGL185CP53100 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.89□□□□□ -0.51
YGL185CP53100 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.89□□□□□ -0.51
YGL185CP53100 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.89□□□□□ -0.51
YGL185CP53100 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.89□□□□□ -0.51
YGL185CP53100 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.89□□□□□ -0.51
YGL185CP53100 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.89□□□□□ -0.51
YGL185CP53100 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.89□□□□□ -0.51
YGL185CP53100 CCC1YLR220W 969 nt11.85□□□□□ -0.51
YGL185CP53100 SCS3YGL126W 1143 nt11.82□□□□□ -0.52
YGL185CP53100 RVS167YDR388W 1449 nt11.72□□□□□ -0.53
YGL185CP53100 SSA4YER103W 1929 nt11.64□□□□□ -0.55
YGL185CP53100 SPT5YML010W 3192 nt11.63□□□□□ -0.55
YGL185CP53100 Q0182Q0182 405 nt11.54□□□□□ -0.56
YGL185CP53100 ARE1YCR048W 1833 nt11.53□□□□□ -0.56
YGL185CP53100 POA1YBR022W 534 nt11.53□□□□□ -0.56
YGL185CP53100 RPP1BYDL130W 321 nt11.5□□□□□ -0.57
YGL185CP53100 YOL085CYOL085C 342 nt11.49□□□□□ -0.57
YGL185CP53100 BSC6YOL137W 1494 nt11.48□□□□□ -0.57
YGL185CP53100 SCJ1YMR214W 1134 nt11.41□□□□□ -0.58
YGL185CP53100 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.4□□□□□ -0.58
YGL185CP53100 PKP1YIL042C 1185 nt11.37□□□□□ -0.59
YGL185CP53100 BDF1YLR399C 2061 nt11.29□□□□□ -0.6
YGL185CP53100 SAH1YER043C 1350 nt11.23□□□□□ -0.61
YGL185CP53100 PAC11YDR488C 1602 nt11.17□□□□□ -0.62
YGL185CP53100 SHR5YOL110W 714 nt11.15□□□□□ -0.62
YGL185CP53100 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.14□□□□□ -0.63
YGL185CP53100 TAT1YBR069C 1860 nt11.14□□□□□ -0.63
YGL185CP53100 URN1YPR152C 1398 nt11.11□□□□□ -0.63
YGL185CP53100 OPI9YLR338W 858 nt11.08□□□□□ -0.64
YGL185CP53100 BUD23YCR047C 828 nt11.03□□□□□ -0.64
YGL185CP53100 SSA1YAL005C 1929 nt11.03□□□□□ -0.64
YGL185CP53100 PET122YER153C 765 nt11.01□□□□□ -0.65
YGL185CP53100 DEP1YAL013W 1218 nt10.96□□□□□ -0.65
YGL185CP53100 NVJ2YPR091C 2313 nt10.96□□□□□ -0.66
YGL185CP53100 RPN10YHR200W 807 nt10.91□□□□□ -0.66
YGL185CP53100 SCR1SCR1 522 nt10.89□□□□□ -0.67
YGL185CP53100 MEP2YNL142W 1500 nt10.86□□□□□ -0.67
YGL185CP53100 MOT3YMR070W 1473 nt10.82□□□□□ -0.68
YGL185CP53100 YDJ1YNL064C 1230 nt10.79□□□□□ -0.68
YGL185CP53100 YNL208WYNL208W 600 nt10.78□□□□□ -0.68
YGL185CP53100 PTC2YER089C 1395 nt10.76□□□□□ -0.69
YGL185CP53100 PUN1YLR414C 792 nt10.75□□□□□ -0.69
YGL185CP53100 NAB2YGL122C 1578 nt10.73□□□□□ -0.69
YGL185CP53100 DCW1YKL046C 1350 nt10.68□□□□□ -0.7
YGL185CP53100 RRN5YLR141W 1092 nt10.67□□□□□ -0.7
YGL185CP53100 GAR1YHR089C 618 nt10.63□□□□□ -0.71
YGL185CP53100 YBR220CYBR220C 1683 nt10.61□□□□□ -0.71
YGL185CP53100 FIS1YIL065C 468 nt10.58□□□□□ -0.72
YGL185CP53100 FPS1YLL043W 2010 nt10.57□□□□□ -0.72
YGL185CP53100 YJR018WYJR018W 363 nt10.56□□□□□ -0.72
YGL185CP53100 EMI2YDR516C 1503 nt10.5□□□□□ -0.73
YGL185CP53100 ATS1YAL020C 1002 nt10.48□□□□□ -0.73
YGL185CP53100 YPS1YLR120C 1710 nt10.47□□□□□ -0.73
YGL185CP53100 YMR090WYMR090W 684 nt10.45□□□□□ -0.74
YGL185CP53100 PCH2YBR186W 1695 nt10.44□□□□□ -0.74
YGL185CP53100 DAL1YIR027C 1383 nt10.44□□□□□ -0.74
YGL185CP53100 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.44□□□□□ -0.74
YGL185CP53100 GUT2YIL155C 1950 nt10.43□□□□□ -0.74
YGL185CP53100 SDH1YKL148C 1923 nt10.4□□□□□ -0.74
YGL185CP53100 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.38□□□□□ -0.75
YGL185CP53100 RSB1YOR049C 1065 nt10.38□□□□□ -0.75
YGL185CP53100 PHO4YFR034C 939 nt10.37□□□□□ -0.75
YGL185CP53100 FPR4YLR449W 1179 nt10.37□□□□□ -0.75
YGL185CP53100 YDL221WYDL221W 552 nt10.36□□□□□ -0.75
YGL185CP53100 SEC11YIR022W 504 nt10.33□□□□□ -0.76
YGL185CP53100 RPP2BYDR382W 333 nt10.31□□□□□ -0.76
YGL185CP53100 TIR1YER011W 765 nt10.28□□□□□ -0.76
YGL185CP53100 YDR095CYDR095C 411 nt10.27□□□□□ -0.77
YGL185CP53100 INM2YDR287W 879 nt10.27□□□□□ -0.77
YGL185CP53100 PIB2YGL023C 1908 nt10.27□□□□□ -0.77
YGL185CP53100 YJR120WYJR120W 351 nt10.22□□□□□ -0.77
YGL185CP53100 CAC2YML102W 1407 nt10.2□□□□□ -0.78
YGL185CP53100 SCC4YER147C 1875 nt10.19□□□□□ -0.78
YGL185CP53100 UME6YDR207C 2511 nt10.16□□□□□ -0.78
YGL185CP53100 PTP1YDL230W 1008 nt10.13□□□□□ -0.79
YGL185CP53100 RTF1YGL244W 1677 nt10.1□□□□□ -0.79
YGL185CP53100 YBL100CYBL100C 315 nt10.08□□□□□ -0.8
YGL185CP53100 YSC84YHR016C 1407 nt10.07□□□□□ -0.8
YGL185CP53100 IRC15YPL017C 1500 nt10.07□□□□□ -0.8
YGL185CP53100 RPP2AYOL039W 321 nt10.05□□□□□ -0.8
YGL185CP53100 BOR1YNL275W 1731 nt10.01□□□□□ -0.81
YGL185CP53100 GIS3YLR094C 1509 nt10.01□□□□□ -0.81
YGL185CP53100 YHL050CYHL050C 2094 nt10□□□□□ -0.81
YGL185CP53100 PTK1YKL198C 1989 nt9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms