RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W FAT1P38225 669 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CDC1P40986 491 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W UFE1P41834 346 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W THI6P41835 540 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PMT6P42934 759 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W FET5P43561 622 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W NIT2P47016 307 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RNR4P49723 345 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W FDC1Q03034 503 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YML096WQ04489 525 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ENT2Q05785 613 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PER33Q12144 273 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W GET3Q12154 354 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W NBP2Q12163 236 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YDR061WQ12298 539 aa2.27□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W KAR1P11927 433 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W GLN4P13188 809 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W MUD1P32605 298 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SGE1P33335 543 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W GPP2P40106 250 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W LCB2P40970 561 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W BUD8P41698 603 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W AIM23P47015 356 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W UBX6P47049 396 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W HRD3Q05787 833 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W BNA5Q05979 453 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YPS7Q06325 596 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W DDC1Q08949 612 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W AFT2Q08957 416 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W FRE7Q12333 620 aa2.26□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W MDM10P18409 493 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CAP1P28495 268 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PLC1P32383 869 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PCA1P38360 1216 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W EXO1P39875 702 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PXA1P41909 870 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SPC105P53148 917 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SUR7P54003 302 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YPL113CQ02961 396 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RIM13Q03792 727 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W STP4Q07351 490 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SRO7Q12038 1033 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ULA1Q12059 462 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W FOB1O13329 566 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W HSP82P02829 709 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W STE12P13574 688 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W COX11P19516 300 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RRT12P25381 491 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W BEM1P29366 551 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W XRS2P33301 854 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W FTR1P40088 404 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W UBP7P40453 1071 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W DSN1P40568 576 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SMC3P47037 1230 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W BNA3P47039 444 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YJR054WP47114 497 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YGL117WP53133 265 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CPR8P53728 308 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ARP5P53946 755 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RSM10Q03201 203 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W GIS3Q12418 502 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SKM1Q12469 655 aa2.25□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CDC42P19073 191 aa2.24□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data2.24□□□□□ -2.05not detected
SSQ1YLR369W PRE4P30657 266 aa2.24□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YMC1P32331 307 aa2.24□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YJL070CP40361 888 aa2.24□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ASG7P46993 209 aa2.24□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YNL144CP53907 740 aa2.24□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ARG7Q04728 441 aa2.24□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ICT1Q12385 394 aa2.24□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ATP12P22135 325 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W LRE1P25579 583 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W CWP1P28319 239 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W DGR2P32330 852 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W HXT4P32467 576 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W EFB1P32471 206 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W PMT1P33775 817 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W ELF1P36053 145 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W YHR033WP38690 423 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W TAF4P50105 388 aa2.23□□□□□ -2.05
SSQ1YLR369W SLD3P53135 668 aa2.23□□□□□ -2.05
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