Protein–RNA interactions for Protein: Q04489

YML096W, Asparagine synthetase domain-containing protein YML096W, yeastyeast

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML096WQ04489 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.93■□□□□ 0.78
YML096WQ04489 NOP1YDL014W 984 nt19.54■□□□□ 0.72
YML096WQ04489 NSR1YGR159C 1245 nt19.53■□□□□ 0.72
YML096WQ04489 YKL036CYKL036C 393 nt18.35■□□□□ 0.53
YML096WQ04489 Q0297Q0297 156 nt17.22■□□□□ 0.35
YML096WQ04489 YJL027CYJL027C 417 nt17.19■□□□□ 0.34
YML096WQ04489 MDJ1YFL016C 1536 nt17.1■□□□□ 0.33
YML096WQ04489 SRX1YKL086W 384 nt17.07■□□□□ 0.32
YML096WQ04489 SCS3YGL126W 1143 nt16.86■□□□□ 0.29
YML096WQ04489 YCR051WYCR051W 669 nt16.21■□□□□ 0.19
YML096WQ04489 YOL085CYOL085C 342 nt15.88■□□□□ 0.13
YML096WQ04489 PKP1YIL042C 1185 nt15.58■□□□□ 0.08
YML096WQ04489 RPP1BYDL130W 321 nt15.45■□□□□ 0.06
YML096WQ04489 SCJ1YMR214W 1134 nt15.41■□□□□ 0.06
YML096WQ04489 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.23■□□□□ 0.03
YML096WQ04489 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.23■□□□□ 0.03
YML096WQ04489 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.23■□□□□ 0.03
YML096WQ04489 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.23■□□□□ 0.03
YML096WQ04489 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.23■□□□□ 0.03
YML096WQ04489 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.23■□□□□ 0.03
YML096WQ04489 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.23■□□□□ 0.03
YML096WQ04489 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.23■□□□□ 0.03
YML096WQ04489 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.23■□□□□ 0.03
YML096WQ04489 DBP2YNL112W 1641 nt15.2■□□□□ 0.02
YML096WQ04489 ATS1YAL020C 1002 nt15.19■□□□□ 0.02
YML096WQ04489 CCC1YLR220W 969 nt15.06■□□□□ 0
YML096WQ04489 PET122YER153C 765 nt14.7□□□□□ -0.06
YML096WQ04489 SCR1SCR1 522 nt14.66□□□□□ -0.06
YML096WQ04489 YBR190WYBR190W 312 nt14.55□□□□□ -0.08
YML096WQ04489 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.52□□□□□ -0.09
YML096WQ04489 RVS167YDR388W 1449 nt14.37□□□□□ -0.11
YML096WQ04489 RRN5YLR141W 1092 nt14.33□□□□□ -0.12
YML096WQ04489 RTC3YHR087W 336 nt14.21□□□□□ -0.13
YML096WQ04489 RSB1YOR049C 1065 nt14.13□□□□□ -0.15
YML096WQ04489 YDJ1YNL064C 1230 nt14.06□□□□□ -0.16
YML096WQ04489 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.04□□□□□ -0.16
YML096WQ04489 PST2YDR032C 597 nt14.01□□□□□ -0.17
YML096WQ04489 SHR5YOL110W 714 nt13.95□□□□□ -0.18
YML096WQ04489 GAR1YHR089C 618 nt13.67□□□□□ -0.22
YML096WQ04489 YKL097CYKL097C 411 nt13.64□□□□□ -0.23
YML096WQ04489 DEP1YAL013W 1218 nt13.4□□□□□ -0.26
YML096WQ04489 URN1YPR152C 1398 nt13.35□□□□□ -0.27
YML096WQ04489 SHU1YHL006C 453 nt13.35□□□□□ -0.27
YML096WQ04489 YNL208WYNL208W 600 nt13.27□□□□□ -0.29
YML096WQ04489 RPN10YHR200W 807 nt13.23□□□□□ -0.29
YML096WQ04489 TIR1YER011W 765 nt13.2□□□□□ -0.3
YML096WQ04489 PUT4YOR348C 1884 nt13.17□□□□□ -0.3
YML096WQ04489 OPI9YLR338W 858 nt13.15□□□□□ -0.3
YML096WQ04489 SAH1YER043C 1350 nt13.05□□□□□ -0.32
YML096WQ04489 YOR139CYOR139C 393 nt13.02□□□□□ -0.33
YML096WQ04489 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.01□□□□□ -0.33
YML096WQ04489 SSA1YAL005C 1929 nt12.96□□□□□ -0.33
YML096WQ04489 ARE1YCR048W 1833 nt12.96□□□□□ -0.33
YML096WQ04489 NPL3YDR432W 1245 nt12.84□□□□□ -0.35
YML096WQ04489 SSA3YBL075C 1950 nt12.83□□□□□ -0.36
YML096WQ04489 SRB2YHR041C 633 nt12.79□□□□□ -0.36
YML096WQ04489 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.77□□□□□ -0.37
YML096WQ04489 PUN1YLR414C 792 nt12.76□□□□□ -0.37
YML096WQ04489 POA1YBR022W 534 nt12.75□□□□□ -0.37
YML096WQ04489 YJR018WYJR018W 363 nt12.74□□□□□ -0.37
YML096WQ04489 YGR021WYGR021W 873 nt12.72□□□□□ -0.37
YML096WQ04489 HOM6YJR139C 1080 nt12.69□□□□□ -0.38
YML096WQ04489 WWM1YFL010C 636 nt12.67□□□□□ -0.38
YML096WQ04489 MNP1YGL068W 585 nt12.66□□□□□ -0.38
YML096WQ04489 YJR120WYJR120W 351 nt12.62□□□□□ -0.39
YML096WQ04489 YOL037CYOL037C 354 nt12.62□□□□□ -0.39
YML096WQ04489 PTC2YER089C 1395 nt12.59□□□□□ -0.39
YML096WQ04489 RPP2BYDR382W 333 nt12.59□□□□□ -0.39
YML096WQ04489 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.5□□□□□ -0.41
YML096WQ04489 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.5□□□□□ -0.41
YML096WQ04489 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.5□□□□□ -0.41
YML096WQ04489 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.5□□□□□ -0.41
YML096WQ04489 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.5□□□□□ -0.41
YML096WQ04489 RKM5YLR137W 1104 nt12.5□□□□□ -0.41
YML096WQ04489 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.48□□□□□ -0.41
YML096WQ04489 BUD23YCR047C 828 nt12.46□□□□□ -0.41
YML096WQ04489 BSC6YOL137W 1494 nt12.46□□□□□ -0.42
YML096WQ04489 NAB2YGL122C 1578 nt12.41□□□□□ -0.42
YML096WQ04489 BDH2YAL061W 1254 nt12.4□□□□□ -0.42
YML096WQ04489 LSM3YLR438C-A 270 nt12.32□□□□□ -0.44
YML096WQ04489 YLR281CYLR281C 468 nt12.29□□□□□ -0.44
YML096WQ04489 INM2YDR287W 879 nt12.28□□□□□ -0.44
YML096WQ04489 PUS2YGL063W 1113 nt12.28□□□□□ -0.44
YML096WQ04489 FIS1YIL065C 468 nt12.27□□□□□ -0.45
YML096WQ04489 DAL1YIR027C 1383 nt12.27□□□□□ -0.45
YML096WQ04489 FPR4YLR449W 1179 nt12.21□□□□□ -0.45
YML096WQ04489 YBL100CYBL100C 315 nt12.19□□□□□ -0.46
YML096WQ04489 WHI5YOR083W 888 nt12.19□□□□□ -0.46
YML096WQ04489 PHO4YFR034C 939 nt12.16□□□□□ -0.46
YML096WQ04489 MOT3YMR070W 1473 nt12.14□□□□□ -0.47
YML096WQ04489 TRM9YML014W 840 nt12.1□□□□□ -0.47
YML096WQ04489 FUN26YAL022C 1554 nt12.05□□□□□ -0.48
YML096WQ04489 DSK2YMR276W 1122 nt11.98□□□□□ -0.49
YML096WQ04489 FMP45YDL222C 930 nt11.97□□□□□ -0.49
YML096WQ04489 CCT6YDR188W 1641 nt11.97□□□□□ -0.49
YML096WQ04489 YPR011CYPR011C 981 nt11.96□□□□□ -0.49
YML096WQ04489 IMP2'YIL154C 1041 nt11.95□□□□□ -0.5
YML096WQ04489 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.94□□□□□ -0.5
YML096WQ04489 YLR236CYLR236C 324 nt11.91□□□□□ -0.5
YML096WQ04489 YPS1YLR120C 1710 nt11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.8 ms