RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR003CP53394 754 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P BOP3P53958 396 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SUR7P54003 302 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CTR9P89105 1077 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P AAT1Q01802 451 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P UTP6Q02354 440 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PET117Q02771 107 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CCE1Q03702 353 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NHX1Q04121 633 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TDA9Q04545 1251 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ECI1Q05871 280 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG23Q06671 453 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MPC54Q08550 464 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NUS1Q12063 375 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MCD1Q12158 566 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RMD5Q12508 421 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TY4A-HQ6Q5P6 413 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P POL2P21951 2222 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P IRA1P18963 3092 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TEF1P02994 458 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC53P07283 254 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P IMA3P0CW40 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P IMA4P0CW41 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MET8P15807 274 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO16P17122 198 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ATP12P22135 325 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PTP1P25044 335 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P AGP1P25376 633 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P IMG1P25626 169 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P URA7P28274 579 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P URA10P30402 227 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GUT2P32191 649 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SIN4P32259 974 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CYM1P32898 989 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SRP101P32916 621 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SDH3P33421 198 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RPF2P36160 344 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CTP1P38152 299 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P FTH1P38310 465 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YHI9P38765 294 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR210CP38893 341 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MET30P39014 640 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RGA1P39083 1007 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PTI1P39927 425 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MGS1P40151 587 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NDC80P40460 691 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NMD5P46970 1048 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P IKS1P47042 667 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P IBA57P47158 497 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RTA1P53047 317 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX8P53248 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P FHN1P53279 174 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ZRG17P53735 605 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ESF2P53743 316 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P COG6P53959 839 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TFB2Q02939 513 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TAF12Q03761 539 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM12Q04235 462 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR109CQ04585 715 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SML1Q04964 104 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RSF1Q05043 376 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ADE13Q05911 482 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GRS2Q06817 618 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P ADY3Q07732 790 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P IMA2Q08295 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR389WQ08912 624 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL278CQ08990 100 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P DIN7Q12086 430 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YPL066WQ12194 479 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P UBX3Q12229 455 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR012WQ12351 137 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PST1Q12355 444 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GTT2Q12390 233 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR111WQ12528 110 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P IPP1P00817 287 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD1P06777 1100 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MST1P07236 462 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P GCR1P07261 785 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SWI5P08153 709 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TYR1P20049 452 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC14P24280 304 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CLB1P24868 471 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P HRR25P29295 494 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P PRO1P32264 428 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P NTH1P32356 751 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MF(ALPHA)2P32435 120 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SMI1P32566 505 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P SFA1P32771 386 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P MGM101P32787 269 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P BEM3P32873 1128 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P TIP20P33891 701 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P THI80P35202 319 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P CAB3P36076 571 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)PtW(CCA)P REI1P38344 393 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms