RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR003CP53394 754 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M BOP3P53958 396 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SUR7P54003 302 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CTR9P89105 1077 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M AAT1Q01802 451 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M UTP6Q02354 440 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PET117Q02771 107 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CCE1Q03702 353 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NHX1Q04121 633 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TDA9Q04545 1251 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ECI1Q05871 280 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG23Q06671 453 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MPC54Q08550 464 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NUS1Q12063 375 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MCD1Q12158 566 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RMD5Q12508 421 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TY4A-HQ6Q5P6 413 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M POL2P21951 2222 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M IRA1P18963 3092 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TEF1P02994 458 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC53P07283 254 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M IMA3P0CW40 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M IMA4P0CW41 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MET8P15807 274 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO16P17122 198 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ATP12P22135 325 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PTP1P25044 335 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M AGP1P25376 633 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M IMG1P25626 169 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M URA7P28274 579 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M URA10P30402 227 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GUT2P32191 649 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SIN4P32259 974 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CYM1P32898 989 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SRP101P32916 621 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SDH3P33421 198 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RPF2P36160 344 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CTP1P38152 299 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M FTH1P38310 465 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YHI9P38765 294 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR210CP38893 341 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MET30P39014 640 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RGA1P39083 1007 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PTI1P39927 425 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MGS1P40151 587 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NDC80P40460 691 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NMD5P46970 1048 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M IKS1P47042 667 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M IBA57P47158 497 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RTA1P53047 317 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX8P53248 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M FHN1P53279 174 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ZRG17P53735 605 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ESF2P53743 316 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M COG6P53959 839 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TFB2Q02939 513 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TAF12Q03761 539 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TRM12Q04235 462 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR109CQ04585 715 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SML1Q04964 104 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RSF1Q05043 376 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ADE13Q05911 482 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GRS2Q06817 618 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M ADY3Q07732 790 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M IMA2Q08295 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR389WQ08912 624 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL278CQ08990 100 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M DIN7Q12086 430 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL066WQ12194 479 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M UBX3Q12229 455 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR012WQ12351 137 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PST1Q12355 444 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GTT2Q12390 233 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR111WQ12528 110 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M IPP1P00817 287 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD1P06777 1100 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MST1P07236 462 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M GCR1P07261 785 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SWI5P08153 709 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TYR1P20049 452 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC14P24280 304 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CLB1P24868 471 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M HRR25P29295 494 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M PRO1P32264 428 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M NTH1P32356 751 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MF(ALPHA)2P32435 120 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SMI1P32566 505 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M SFA1P32771 386 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M MGM101P32787 269 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M BEM3P32873 1128 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M TIP20P33891 701 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M THI80P35202 319 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M CAB3P36076 571 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)MtW(CCA)M REI1P38344 393 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
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