RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR003CP53394 754 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K BOP3P53958 396 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SUR7P54003 302 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CTR9P89105 1077 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K AAT1Q01802 451 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K UTP6Q02354 440 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PET117Q02771 107 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CCE1Q03702 353 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NHX1Q04121 633 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TDA9Q04545 1251 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ECI1Q05871 280 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG23Q06671 453 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MPC54Q08550 464 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NUS1Q12063 375 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MCD1Q12158 566 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RMD5Q12508 421 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TY4A-HQ6Q5P6 413 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K POL2P21951 2222 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K IRA1P18963 3092 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TEF1P02994 458 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC53P07283 254 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K IMA3P0CW40 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K IMA4P0CW41 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MET8P15807 274 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO16P17122 198 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ATP12P22135 325 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PTP1P25044 335 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K AGP1P25376 633 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K IMG1P25626 169 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K URA7P28274 579 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K URA10P30402 227 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GUT2P32191 649 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SIN4P32259 974 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CYM1P32898 989 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SRP101P32916 621 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SDH3P33421 198 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RPF2P36160 344 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CTP1P38152 299 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K FTH1P38310 465 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YHI9P38765 294 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR210CP38893 341 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MET30P39014 640 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RGA1P39083 1007 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PTI1P39927 425 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MGS1P40151 587 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NDC80P40460 691 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NMD5P46970 1048 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K IKS1P47042 667 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K IBA57P47158 497 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RTA1P53047 317 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX8P53248 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K FHN1P53279 174 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ZRG17P53735 605 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ESF2P53743 316 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K COG6P53959 839 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TFB2Q02939 513 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TAF12Q03761 539 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TRM12Q04235 462 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR109CQ04585 715 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SML1Q04964 104 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RSF1Q05043 376 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ADE13Q05911 482 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GRS2Q06817 618 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K ADY3Q07732 790 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K IMA2Q08295 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR389WQ08912 624 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL278CQ08990 100 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K DIN7Q12086 430 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL066WQ12194 479 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K UBX3Q12229 455 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR012WQ12351 137 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PST1Q12355 444 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GTT2Q12390 233 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR111WQ12528 110 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K IPP1P00817 287 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD1P06777 1100 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MST1P07236 462 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K GCR1P07261 785 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SWI5P08153 709 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TYR1P20049 452 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC14P24280 304 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CLB1P24868 471 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K HRR25P29295 494 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K PRO1P32264 428 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K NTH1P32356 751 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MF(ALPHA)2P32435 120 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SMI1P32566 505 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K SFA1P32771 386 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K MGM101P32787 269 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K BEM3P32873 1128 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K TIP20P33891 701 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K THI80P35202 319 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K CAB3P36076 571 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)KtW(CCA)K REI1P38344 393 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.1 ms