RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR003CP53394 754 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J BOP3P53958 396 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SUR7P54003 302 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CTR9P89105 1077 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J AAT1Q01802 451 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP6Q02354 440 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PET117Q02771 107 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CCE1Q03702 353 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NHX1Q04121 633 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TDA9Q04545 1251 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ECI1Q05871 280 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG23Q06671 453 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MPC54Q08550 464 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NUS1Q12063 375 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MCD1Q12158 566 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RMD5Q12508 421 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TY4A-HQ6Q5P6 413 aa2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J POL2P21951 2222 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J IRA1P18963 3092 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TEF1P02994 458 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC53P07283 254 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J IMA3P0CW40 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J IMA4P0CW41 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MET8P15807 274 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO16P17122 198 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP12P22135 325 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PTP1P25044 335 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J AGP1P25376 633 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J IMG1P25626 169 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J URA7P28274 579 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J URA10P30402 227 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GUT2P32191 649 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SIN4P32259 974 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CYM1P32898 989 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SRP101P32916 621 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SDH3P33421 198 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RPF2P36160 344 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CTP1P38152 299 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J FTH1P38310 465 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YHI9P38765 294 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR210CP38893 341 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MET30P39014 640 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RGA1P39083 1007 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PTI1P39927 425 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MGS1P40151 587 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NDC80P40460 691 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NMD5P46970 1048 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J IKS1P47042 667 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J IBA57P47158 497 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RTA1P53047 317 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX8P53248 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J FHN1P53279 174 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ZRG17P53735 605 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ESF2P53743 316 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J COG6P53959 839 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TFB2Q02939 513 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TAF12Q03761 539 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TRM12Q04235 462 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR109CQ04585 715 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SML1Q04964 104 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RSF1Q05043 376 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ADE13Q05911 482 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GRS2Q06817 618 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J ADY3Q07732 790 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J IMA2Q08295 589 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR389WQ08912 624 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL278CQ08990 100 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J DIN7Q12086 430 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL066WQ12194 479 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J UBX3Q12229 455 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR012WQ12351 137 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PST1Q12355 444 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GTT2Q12390 233 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR111WQ12528 110 aa2.57□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J IPP1P00817 287 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD1P06777 1100 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MST1P07236 462 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J GCR1P07261 785 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SWI5P08153 709 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TYR1P20049 452 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC14P24280 304 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CLB1P24868 471 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J HRR25P29295 494 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J PRO1P32264 428 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J NTH1P32356 751 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MF(ALPHA)2P32435 120 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SMI1P32566 505 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J SFA1P32771 386 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J MGM101P32787 269 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J BEM3P32873 1128 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J TIP20P33891 701 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J THI80P35202 319 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J CAB3P36076 571 aa2.56□□□□□ -2
tW(CCA)JtW(CCA)J REI1P38344 393 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.8 ms