RNA–Protein interactions for RNA: YKL088W

CAB3, Transcript of Subunit of PPCDC and CoA-SPC complexes involved in CoA biosynthesis, yeast

Gene CAB3, Length 1,716 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CAB3	YKL088W	SUL2	Q12325	893 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	GPR1	Q12361	961 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	APC2	Q12440	853 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	RAS1	P01119	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	TUP1	P16649	713 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	RPO26	P20435	155 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	ERG8	P24521	451 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	PRE4	P30657	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	RPC37	P36121	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	UBP13	P38187	747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	SIP3	P38717	1229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	PIH1	P38768	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	CEM1	P39525	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	PZF1	P39933	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	RGI2	P40188	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	KEL2	P50090	882 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	GLO1	P50107	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	FMS1	P50264	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	SCW11	P53189	542 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	YGR012W	P53206	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	TOF1	P53840	1238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	PGA2	P53903	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	MFM1	Q02783	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	TRS31	Q03337	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	SOV1	Q04748	898 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	FUS2	Q05670	677 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	ATG23	Q06671	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	MLH2	Q07980	695 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	GPM3	Q12326	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	CKI1	P20485	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	YCR051W	P25631	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	APL1	P27351	700 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	HXT1	P32465	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	GYP6	P32806	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	ALY1	P36117	915 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	CDS1	P38221	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	SIF2	P38262	535 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	AAD10	P47182	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	VPS36	Q06696	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	CDA1	Q06702	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	FMP45	Q07651	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	TCO89	Q08921	799 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAB3	YKL088W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	POL4	P25615	582 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	CTF8	P38877	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	VPS41	P38959	992 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
CAB3	YKL088W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	ATF1	P40353	525 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	SWA2	Q06677	668 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	AIM6	Q07716	390 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	ARP6	Q12509	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	TDP1	P38319	544 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	SFB3	P38810	929 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	JHD1	P40034	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	YNL195C	P40168	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	PFA3	P42836	336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	COX18	P53239	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	SOL4	P53315	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	DIP5	P53388	608 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	REC102	Q02721	264 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	GAD1	Q04792	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	GTB1	Q04924	702 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	SIL1	Q08199	421 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	DAS2	Q12084	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	CPR2	P23285	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	YPT7	P32939	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAB3	YKL088W	PPQ1	P32945	549 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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