RNA–Protein interactions for RNA: YIL039W

TED1, Transcript of Conserved phosphoesterase domain-containing protein, yeast

Gene TED1, Length 1,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TED1	YIL039W	SPE2	P21182	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	ASK1	P35734	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	VTC3	Q02725	835 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	CBF2	P32504	956 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	YAP3	P38749	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	CTK2	P46962	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	RAD9	P14737	1309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TED1	YIL039W	DPB3	P27344	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	ALY1	P36117	915 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SNM1	P40993	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	IME4	P41833	600 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	CBK1	P53894	756 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	MPS1	P54199	764 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SEC5	P89102	971 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	RCO1	Q04779	684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
TED1	YIL039W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	STE50	P25344	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YIR016W	P40572	265 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	UBP8	P50102	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	MEP3	P53390	489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YTP1	P53584	459 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	ASI1	P54074	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SWF1	Q04629	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	NUS1	Q12063	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	ATX2	Q12067	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	RAP1	P11938	827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	RER1	P25560	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	MGM1	P32266	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SSH4	P32343	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SPC97	P38863	823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	VPS25	P47142	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	GSH2	Q08220	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	CIR2	Q08822	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	CDC15	P27636	974 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SLZ1	P40167	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YJR061W	P40355	935 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	MDV1	P47025	714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	CAC2	Q04199	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	ENT4	Q07872	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	MCM10	P32354	571 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
TED1	YIL039W	INN1	P53901	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	MUB1	Q03162	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	IZH1	Q03419	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	ATG9	Q12142	997 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	CDC45	Q08032	650 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	USO1	P25386	1790 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	VID27	P40157	782 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SIP4	P46954	829 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	IRC8	P47046	822 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	SGF73	P53165	657 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	NNF2	P53253	936 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	NBP2	Q12163	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TED1	YIL039W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	CLB2	P24869	491 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	ATO2	P32907	282 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	VRG4	P40107	337 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	YIL152W	P40455	235 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	AAD10	P47182	288 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	POS5	Q06892	414 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	SNA4	Q07549	140 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	MLH2	Q07980	695 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	DSE3	Q08729	430 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TED1	YIL039W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.7 ms