RNA–Protein interactions for RNA: YGR033C

TIM21, Transcript of Nonessential component of the TIM23 complex, yeast

Gene TIM21, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIM21	YGR033C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	AIM32	Q04689	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	THI3	Q07471	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ULA1	Q12059	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	RLM1	Q12224	676 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	APN1	P22936	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	IMG1	P25626	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ADK2	P26364	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	GSH1	P32477	678 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	RPC34	P32910	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PMT1	P33775	817 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	EXO1	P39875	702 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	TWF1	P53250	332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	BOP3	P53958	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	EFM6	P53970	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	PFA5	Q03289	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	TMN2	Q04562	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	APL4	Q12028	832 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	RPN13	O13563	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	RAP1	P11938	827 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YCR051W	P25631	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	MSS51	P32335	436 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YME1	P32795	747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	YBR144C	P34215	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ICS2	P38284	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ELO1	P39540	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	IRC24	P40580	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	HXT14	P42833	540 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	SMC3	P47037	1230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	ATG9	Q12142	997 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM21	YGR033C	MRP13	P12686	339 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	SPO11	P23179	398 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	MNE1	P24720	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	CLB1	P24868	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	YMC1	P32331	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	TFB1	P32776	642 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	OAR1	P35731	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	MOH1	P38191	138 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	CHS7	P38843	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	ZIM17	P42844	174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	GYL1	Q04322	720 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	RAD34	Q06665	692 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	AFI1	Q99222	893 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	STE50	P25344	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	SYN8	P31377	255 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	EMP70	P32802	667 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	DBP8	P38719	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	YJL055W	P47044	245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	YPR003C	P53394	754 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	VPS9	P54787	451 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	FMP30	Q02883	468 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	FIN1	Q03898	291 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	TEN1	Q07921	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	YCR006C	P25350	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	BOS1	P25385	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	MRE11	P32829	692 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	YEL020C	P39994	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	LCB2	P40970	561 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	ROY1	Q04847	553 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	SEC39	Q12745	709 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	MDL1	P33310	695 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	FTH1	P38310	465 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	MRK1	P50873	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	CTF4	Q01454	927 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	VTA1	Q06263	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TIM21	YGR033C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected

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