Protein–RNA interactions for Protein: Q12224

RLM1, Transcription factor RLM1, yeastyeast

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RLM1Q12224 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.42■□□□□ 0.54
RLM1Q12224 NSR1YGR159C 1245 nt18.34■□□□□ 0.53
RLM1Q12224 NOP1YDL014W 984 nt17.86■□□□□ 0.45
RLM1Q12224 MDJ1YFL016C 1536 nt16.4■□□□□ 0.22
RLM1Q12224 YKL036CYKL036C 393 nt16.38■□□□□ 0.21
RLM1Q12224 SRX1YKL086W 384 nt15.57■□□□□ 0.08
RLM1Q12224 Q0297Q0297 156 nt15.56■□□□□ 0.08
RLM1Q12224 YJL027CYJL027C 417 nt15.29■□□□□ 0.04
RLM1Q12224 SCS3YGL126W 1143 nt14.86□□□□□ -0.03
RLM1Q12224 YCR051WYCR051W 669 nt14.8□□□□□ -0.04
RLM1Q12224 DBP2YNL112W 1641 nt14.43□□□□□ -0.1
RLM1Q12224 YOL085CYOL085C 342 nt14.17□□□□□ -0.14
RLM1Q12224 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.15□□□□□ -0.14
RLM1Q12224 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.15□□□□□ -0.14
RLM1Q12224 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.15□□□□□ -0.14
RLM1Q12224 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.15□□□□□ -0.14
RLM1Q12224 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.15□□□□□ -0.14
RLM1Q12224 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
RLM1Q12224 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
RLM1Q12224 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.15□□□□□ -0.14
RLM1Q12224 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.15□□□□□ -0.14
RLM1Q12224 CCC1YLR220W 969 nt14.02□□□□□ -0.17
RLM1Q12224 YBR190WYBR190W 312 nt13.99□□□□□ -0.17
RLM1Q12224 RPP1BYDL130W 321 nt13.98□□□□□ -0.17
RLM1Q12224 PKP1YIL042C 1185 nt13.98□□□□□ -0.17
RLM1Q12224 RTC3YHR087W 336 nt13.71□□□□□ -0.21
RLM1Q12224 RVS167YDR388W 1449 nt13.63□□□□□ -0.23
RLM1Q12224 SCJ1YMR214W 1134 nt13.49□□□□□ -0.25
RLM1Q12224 PET122YER153C 765 nt13.37□□□□□ -0.27
RLM1Q12224 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.34□□□□□ -0.27
RLM1Q12224 ATS1YAL020C 1002 nt13.24□□□□□ -0.29
RLM1Q12224 SCR1SCR1 522 nt13.24□□□□□ -0.29
RLM1Q12224 SHR5YOL110W 714 nt13.09□□□□□ -0.31
RLM1Q12224 RRN5YLR141W 1092 nt12.96□□□□□ -0.33
RLM1Q12224 YDJ1YNL064C 1230 nt12.9□□□□□ -0.34
RLM1Q12224 URN1YPR152C 1398 nt12.79□□□□□ -0.36
RLM1Q12224 PUT4YOR348C 1884 nt12.76□□□□□ -0.37
RLM1Q12224 DEP1YAL013W 1218 nt12.76□□□□□ -0.37
RLM1Q12224 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.71□□□□□ -0.37
RLM1Q12224 RSB1YOR049C 1065 nt12.7□□□□□ -0.38
RLM1Q12224 GAR1YHR089C 618 nt12.65□□□□□ -0.38
RLM1Q12224 RPN10YHR200W 807 nt12.61□□□□□ -0.39
RLM1Q12224 OPI9YLR338W 858 nt12.6□□□□□ -0.39
RLM1Q12224 YNL208WYNL208W 600 nt12.55□□□□□ -0.4
RLM1Q12224 SAH1YER043C 1350 nt12.55□□□□□ -0.4
RLM1Q12224 ARE1YCR048W 1833 nt12.51□□□□□ -0.41
RLM1Q12224 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.39□□□□□ -0.43
RLM1Q12224 POA1YBR022W 534 nt12.36□□□□□ -0.43
RLM1Q12224 PST2YDR032C 597 nt12.26□□□□□ -0.45
RLM1Q12224 PUN1YLR414C 792 nt12.26□□□□□ -0.45
RLM1Q12224 TIR1YER011W 765 nt12.22□□□□□ -0.45
RLM1Q12224 YJR018WYJR018W 363 nt12.18□□□□□ -0.46
RLM1Q12224 BSC6YOL137W 1494 nt12.12□□□□□ -0.47
RLM1Q12224 PTC2YER089C 1395 nt12.11□□□□□ -0.47
RLM1Q12224 BUD23YCR047C 828 nt12.1□□□□□ -0.47
RLM1Q12224 SSA1YAL005C 1929 nt12.09□□□□□ -0.47
RLM1Q12224 SSA3YBL075C 1950 nt12.07□□□□□ -0.48
RLM1Q12224 Q0182Q0182 405 nt12.05□□□□□ -0.48
RLM1Q12224 NAB2YGL122C 1578 nt11.97□□□□□ -0.49
RLM1Q12224 RPP2BYDR382W 333 nt11.95□□□□□ -0.5
RLM1Q12224 YJR120WYJR120W 351 nt11.94□□□□□ -0.5
RLM1Q12224 SRB2YHR041C 633 nt11.84□□□□□ -0.51
RLM1Q12224 DAL1YIR027C 1383 nt11.8□□□□□ -0.52
RLM1Q12224 SHU1YHL006C 453 nt11.8□□□□□ -0.52
RLM1Q12224 FIS1YIL065C 468 nt11.8□□□□□ -0.52
RLM1Q12224 FPR4YLR449W 1179 nt11.8□□□□□ -0.52
RLM1Q12224 YKL097CYKL097C 411 nt11.77□□□□□ -0.53
RLM1Q12224 INM2YDR287W 879 nt11.75□□□□□ -0.53
RLM1Q12224 PHO4YFR034C 939 nt11.7□□□□□ -0.54
RLM1Q12224 WWM1YFL010C 636 nt11.66□□□□□ -0.54
RLM1Q12224 BDH2YAL061W 1254 nt11.66□□□□□ -0.54
RLM1Q12224 YBL100CYBL100C 315 nt11.65□□□□□ -0.54
RLM1Q12224 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.64□□□□□ -0.55
RLM1Q12224 YGR021WYGR021W 873 nt11.6□□□□□ -0.55
RLM1Q12224 SPT5YML010W 3192 nt11.55□□□□□ -0.56
RLM1Q12224 HOM6YJR139C 1080 nt11.53□□□□□ -0.56
RLM1Q12224 MOT3YMR070W 1473 nt11.52□□□□□ -0.56
RLM1Q12224 FUN26YAL022C 1554 nt11.5□□□□□ -0.57
RLM1Q12224 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.49□□□□□ -0.57
RLM1Q12224 MNP1YGL068W 585 nt11.48□□□□□ -0.57
RLM1Q12224 LSM3YLR438C-A 270 nt11.48□□□□□ -0.57
RLM1Q12224 YPS1YLR120C 1710 nt11.48□□□□□ -0.57
RLM1Q12224 TRM9YML014W 840 nt11.46□□□□□ -0.57
RLM1Q12224 YDR095CYDR095C 411 nt11.4□□□□□ -0.58
RLM1Q12224 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.39□□□□□ -0.59
RLM1Q12224 ALF1YNL148C 765 nt11.39□□□□□ -0.59
RLM1Q12224 MEP2YNL142W 1500 nt11.38□□□□□ -0.59
RLM1Q12224 RKM5YLR137W 1104 nt11.37□□□□□ -0.59
RLM1Q12224 CCT6YDR188W 1641 nt11.35□□□□□ -0.59
RLM1Q12224 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.29□□□□□ -0.6
RLM1Q12224 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.29□□□□□ -0.6
RLM1Q12224 YOR139CYOR139C 393 nt11.27□□□□□ -0.61
RLM1Q12224 NPL3YDR432W 1245 nt11.26□□□□□ -0.61
RLM1Q12224 YOL037CYOL037C 354 nt11.26□□□□□ -0.61
RLM1Q12224 SSA4YER103W 1929 nt11.2□□□□□ -0.62
RLM1Q12224 DCW1YKL046C 1350 nt11.19□□□□□ -0.62
RLM1Q12224 RPP2AYOL039W 321 nt11.18□□□□□ -0.62
RLM1Q12224 SIS1YNL007C 1059 nt11.16□□□□□ -0.62
RLM1Q12224 PTP1YDL230W 1008 nt11.11□□□□□ -0.63
RLM1Q12224 EMI2YDR516C 1503 nt11.06□□□□□ -0.64
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