RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	ANP1	P32629	500 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	UBP8	P50102	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	FOL1	P53848	824 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	PRE8	P23639	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	RIT1	P23796	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YBL028C	P38202	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	VRG4	P40107	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	ARP5	P53946	755 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	BET4	Q00618	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	VPS20	Q04272	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	TFC6	Q06339	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	MAK31	P23059	88 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	CST26	P38226	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	RTT107	P38850	1070 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	CSM2	P40465	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	CAB2	P40506	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	QRI7	P43122	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	CTF18	P49956	741 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	ARP7	Q12406	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	CHS3	P29465	1165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	HES1	P35843	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	VPS41	P38959	992 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YIL089W	P40500	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	EPL1	P43572	832 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	MAD3	P47074	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
SLX1	YBR228W	IME2	P32581	645 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	MNN2	P38069	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLX1	YBR228W	PHO2	P07269	559 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	NUC1	P08466	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	BIK1	P11709	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	ACA1	P39970	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	PCL6	P40038	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	SKP2	P42843	763 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	FMP42	Q04991	504 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	PIG1	Q06216	648 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	POS5	Q06892	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	FRE3	Q08905	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	ECM29	P38737	1868 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	MRC1	P25588	1096 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	PPZ1	P26570	692 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	PES4	P39684	611 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	DJP1	P40564	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	TAM41	P53230	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	GPA1	P08539	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	RKM3	P38222	552 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	RXT2	P38255	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	VPS45	P38932	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	ASG1	P40467	964 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	ATG21	Q02887	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	SWF1	Q04629	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	POL3	P15436	1097 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	RDS1	P25611	832 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	URK1	P27515	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	MAL33	P38157	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLX1	YBR228W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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