RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C ARP9Q05123 467 aa3.72□□□□□ -1.81
SUP53tL(CAA)C GLO2Q05584 274 aa3.72□□□□□ -1.81
SUP53tL(CAA)C TPO4Q12256 659 aa3.72□□□□□ -1.81
SUP53tL(CAA)C FRT1Q99332 602 aa3.72□□□□□ -1.81
SUP53tL(CAA)C MST1P07236 462 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C GAL7P08431 366 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C SPS1P08458 490 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C TRX1P22217 103 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C VAN1P23642 535 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YCR015CP25616 317 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C ORC2P32833 620 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C TRM7P38238 310 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C EFM2P38347 419 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C TDA3P38758 523 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C STN1P38960 494 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C DSS1P39112 969 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C ERP2P39704 215 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C TOK1P40310 691 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C ROK1P45818 564 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YJL132WP47014 750 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C AAT1Q01802 451 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YDR541CQ03049 344 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C EBS1Q03466 884 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YDR209CQ03480 137 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C RRN11Q04712 507 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C HAL9Q12180 1030 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YRM1Q12340 786 aa3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C PHO2P07269 559 aa3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C FAA1P30624 700 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C MMS21P38632 267 aa3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C TDA11P38854 504 aa3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C AIM18P38884 321 aa3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C KHA1P40309 873 aa3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YJL049WP47048 450 aa3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data3.7□□□□□ -1.82not detected
SUP53tL(CAA)C IBA57P47158 497 aa3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C LDB18Q07887 179 aa3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C CIR2Q08822 631 aa3.7□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C BIK1P11709 440 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C CDC26P14724 124 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C REC107P21651 314 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C EMC1P25574 760 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C MRC1P25588 1096 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C KIP2P28743 706 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C MCM5P29496 775 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C PRO1P32264 428 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C MKK2P32491 506 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C SFA1P32771 386 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YRO2P38079 344 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C OM14P38325 134 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C OTU2P38747 307 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YDR089WP38966 869 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data3.69□□□□□ -1.82not detected
SUP53tL(CAA)C VRG4P40107 337 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YJL107CP42947 387 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C BNA3P47039 444 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C ERG26P53199 349 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C BSC5P53755 489 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C SED5Q01590 340 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C NUP100Q02629 959 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C ENT5Q03769 411 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C SXM1Q04175 944 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C HDA3Q06623 655 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C BUD7Q08754 746 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C SEY1Q99287 776 aa3.69□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C TYR1P20049 452 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C SFL1P20134 766 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C AGP1P25376 633 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C RSC6P25632 483 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C MGM101P32787 269 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C UGP1P32861 499 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C SFC1P33303 322 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C RPS27AP35997 82 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C EBP2P36049 427 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C MCM7P38132 845 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C RPS27BP38711 82 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C AIR1P40507 360 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C CUP9P41817 306 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C MNN11P46985 422 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C ZRG17P53735 605 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C ATG4P53867 494 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C VPS9P54787 451 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C TPP1Q03796 238 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C BSC2Q05611 235 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C YDR278CQ05612 105 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C GIC2Q06648 383 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C TGL5Q12043 749 aa3.68□□□□□ -1.82
SUP53tL(CAA)C BAG7Q12128 409 aa3.68□□□□□ -1.82
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