Protein–RNA interactions for Protein: Q07887

LDB18, Protein LDB18, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB18Q07887 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.75■□□□□ 0.91
LDB18Q07887 NSR1YGR159C 1245 nt20.64■□□□□ 0.89
LDB18Q07887 NOP1YDL014W 984 nt20.22■□□□□ 0.83
LDB18Q07887 YKL036CYKL036C 393 nt18.64■□□□□ 0.57
LDB18Q07887 MDJ1YFL016C 1536 nt18.26■□□□□ 0.51
LDB18Q07887 Q0297Q0297 156 nt17.67■□□□□ 0.42
LDB18Q07887 SRX1YKL086W 384 nt17.64■□□□□ 0.41
LDB18Q07887 YJL027CYJL027C 417 nt17.4■□□□□ 0.38
LDB18Q07887 SCS3YGL126W 1143 nt16.93■□□□□ 0.3
LDB18Q07887 YCR051WYCR051W 669 nt16.74■□□□□ 0.27
LDB18Q07887 DBP2YNL112W 1641 nt16.15■□□□□ 0.18
LDB18Q07887 YOL085CYOL085C 342 nt16.12■□□□□ 0.17
LDB18Q07887 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LDB18Q07887 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LDB18Q07887 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LDB18Q07887 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LDB18Q07887 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LDB18Q07887 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LDB18Q07887 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LDB18Q07887 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LDB18Q07887 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.93■□□□□ 0.14
LDB18Q07887 RPP1BYDL130W 321 nt15.86■□□□□ 0.13
LDB18Q07887 PKP1YIL042C 1185 nt15.86■□□□□ 0.13
LDB18Q07887 CCC1YLR220W 969 nt15.77■□□□□ 0.12
LDB18Q07887 YBR190WYBR190W 312 nt15.61■□□□□ 0.09
LDB18Q07887 RTC3YHR087W 336 nt15.27■□□□□ 0.04
LDB18Q07887 RVS167YDR388W 1449 nt15.26■□□□□ 0.03
LDB18Q07887 ATS1YAL020C 1002 nt15.16■□□□□ 0.02
LDB18Q07887 PET122YER153C 765 nt15.13■□□□□ 0.01
LDB18Q07887 SCJ1YMR214W 1134 nt15.11■□□□□ 0.01
LDB18Q07887 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.08■□□□□ 0
LDB18Q07887 SCR1SCR1 522 nt15.02■□□□□ -0
LDB18Q07887 SHR5YOL110W 714 nt14.71□□□□□ -0.05
LDB18Q07887 RRN5YLR141W 1092 nt14.7□□□□□ -0.06
LDB18Q07887 YDJ1YNL064C 1230 nt14.6□□□□□ -0.07
LDB18Q07887 RSB1YOR049C 1065 nt14.42□□□□□ -0.1
LDB18Q07887 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.4□□□□□ -0.1
LDB18Q07887 URN1YPR152C 1398 nt14.28□□□□□ -0.12
LDB18Q07887 GAR1YHR089C 618 nt14.26□□□□□ -0.13
LDB18Q07887 DEP1YAL013W 1218 nt14.26□□□□□ -0.13
LDB18Q07887 RPN10YHR200W 807 nt14.13□□□□□ -0.15
LDB18Q07887 PUT4YOR348C 1884 nt14.12□□□□□ -0.15
LDB18Q07887 OPI9YLR338W 858 nt14.08□□□□□ -0.16
LDB18Q07887 YNL208WYNL208W 600 nt14.08□□□□□ -0.16
LDB18Q07887 PST2YDR032C 597 nt14.03□□□□□ -0.16
LDB18Q07887 SAH1YER043C 1350 nt13.96□□□□□ -0.17
LDB18Q07887 ARE1YCR048W 1833 nt13.87□□□□□ -0.19
LDB18Q07887 TIR1YER011W 765 nt13.79□□□□□ -0.2
LDB18Q07887 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.71□□□□□ -0.21
LDB18Q07887 POA1YBR022W 534 nt13.71□□□□□ -0.21
LDB18Q07887 PUN1YLR414C 792 nt13.7□□□□□ -0.22
LDB18Q07887 YJR018WYJR018W 363 nt13.64□□□□□ -0.23
LDB18Q07887 SSA1YAL005C 1929 nt13.58□□□□□ -0.23
LDB18Q07887 YKL097CYKL097C 411 nt13.51□□□□□ -0.25
LDB18Q07887 PTC2YER089C 1395 nt13.49□□□□□ -0.25
LDB18Q07887 SHU1YHL006C 453 nt13.45□□□□□ -0.26
LDB18Q07887 BUD23YCR047C 828 nt13.41□□□□□ -0.26
LDB18Q07887 RPP2BYDR382W 333 nt13.4□□□□□ -0.26
LDB18Q07887 BSC6YOL137W 1494 nt13.4□□□□□ -0.26
LDB18Q07887 YJR120WYJR120W 351 nt13.37□□□□□ -0.27
LDB18Q07887 NAB2YGL122C 1578 nt13.33□□□□□ -0.28
LDB18Q07887 SRB2YHR041C 633 nt13.31□□□□□ -0.28
LDB18Q07887 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.23□□□□□ -0.29
LDB18Q07887 INM2YDR287W 879 nt13.18□□□□□ -0.3
LDB18Q07887 WWM1YFL010C 636 nt13.16□□□□□ -0.3
LDB18Q07887 DAL1YIR027C 1383 nt13.16□□□□□ -0.3
LDB18Q07887 YGR021WYGR021W 873 nt13.13□□□□□ -0.31
LDB18Q07887 FPR4YLR449W 1179 nt13.13□□□□□ -0.31
LDB18Q07887 FIS1YIL065C 468 nt13.11□□□□□ -0.31
LDB18Q07887 BDH2YAL061W 1254 nt13.11□□□□□ -0.31
LDB18Q07887 SSA3YBL075C 1950 nt13.06□□□□□ -0.32
LDB18Q07887 HOM6YJR139C 1080 nt13.05□□□□□ -0.32
LDB18Q07887 YBL100CYBL100C 315 nt13.03□□□□□ -0.32
LDB18Q07887 PHO4YFR034C 939 nt13.02□□□□□ -0.33
LDB18Q07887 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.98□□□□□ -0.33
LDB18Q07887 MNP1YGL068W 585 nt12.96□□□□□ -0.33
LDB18Q07887 LSM3YLR438C-A 270 nt12.96□□□□□ -0.33
LDB18Q07887 YOR139CYOR139C 393 nt12.91□□□□□ -0.34
LDB18Q07887 RKM5YLR137W 1104 nt12.87□□□□□ -0.35
LDB18Q07887 TRM9YML014W 840 nt12.87□□□□□ -0.35
LDB18Q07887 FUN26YAL022C 1554 nt12.86□□□□□ -0.35
LDB18Q07887 NPL3YDR432W 1245 nt12.86□□□□□ -0.35
LDB18Q07887 YOL037CYOL037C 354 nt12.81□□□□□ -0.36
LDB18Q07887 YPS1YLR120C 1710 nt12.76□□□□□ -0.37
LDB18Q07887 CCT6YDR188W 1641 nt12.72□□□□□ -0.37
LDB18Q07887 ALF1YNL148C 765 nt12.71□□□□□ -0.37
LDB18Q07887 YDR095CYDR095C 411 nt12.69□□□□□ -0.38
LDB18Q07887 SPT5YML010W 3192 nt12.68□□□□□ -0.38
LDB18Q07887 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.65□□□□□ -0.38
LDB18Q07887 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.65□□□□□ -0.38
LDB18Q07887 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.64□□□□□ -0.39
LDB18Q07887 MEP2YNL142W 1500 nt12.57□□□□□ -0.4
LDB18Q07887 YLR281CYLR281C 468 nt12.49□□□□□ -0.41
LDB18Q07887 SIS1YNL007C 1059 nt12.49□□□□□ -0.41
LDB18Q07887 RPP2AYOL039W 321 nt12.46□□□□□ -0.41
LDB18Q07887 WHI5YOR083W 888 nt12.45□□□□□ -0.42
LDB18Q07887 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.43□□□□□ -0.42
LDB18Q07887 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.43□□□□□ -0.42
LDB18Q07887 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.43□□□□□ -0.42
LDB18Q07887 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.43□□□□□ -0.42
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