RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C SKP2P42843 763 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ZAP1P47043 880 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C HOS2P53096 452 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C GTR1Q00582 310 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YMR317WQ04893 1140 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ECI1Q05871 280 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C FRE3Q08905 711 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C APL5Q08951 932 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YMR230W-AQ3E7B5 62 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C SSM4P40318 1319 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C XRS2P33301 854 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PSY4P38193 441 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C RKM3P38222 552 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C IFA38P38286 347 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C NPR3P38742 1146 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C UBP8P50102 471 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C STP3Q05937 343 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YLR455WQ06188 304 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ATG23Q06671 453 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YLR112WQ12130 139 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C COX17Q12287 69 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YML003WP0CF16 290 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PPZ1P26570 692 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C DPB3P27344 201 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C FUN12P39730 1002 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ASG1P40467 964 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C DJP1P40564 432 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C IML2P47031 731 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C VPS25P47142 202 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YDR109CQ04585 715 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C RTT103Q05543 409 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C POS5Q06892 414 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C VAM6Q07468 1049 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PCD1Q12524 340 aa2.03□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C TPK1P06244 397 aa2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C STE50P25344 346 aa2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SEC1P30619 724 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C RAD16P31244 790 aa2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C BNA1P47096 177 aa2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C CTF18P49956 741 aa2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C ESBP6P53918 673 aa2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C ASI1P54074 624 aa2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C DIG1Q03063 452 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YML131WQ03102 365 aa2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YMR254CQ04838 102 aa2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TFC6Q06339 672 aa2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C CSR1Q06705 408 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C ATP2P00830 511 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SNF1P06782 633 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C MRP2P10663 115 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C NOP1P15646 327 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data2.01□□□□□ -2.09not detected
HDA3YPR179C SRP54P20424 541 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C LRE1P25579 583 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C NUP120P35729 1037 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C UME6P39001 836 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C UBX6P47049 396 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YGL260WP53056 76 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C COG1P53079 417 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C ADE16P54113 591 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C IZH1Q03419 316 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TRM8Q12009 286 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YCR006CP25350 157 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C RFA2P26754 273 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SLC1P33333 303 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TEF4P36008 412 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C VRG4P40107 337 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C YIL161WP40449 235 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C PSP1P50896 841 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C MAK10Q02197 733 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C FMP42Q04991 504 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C VID22Q05934 901 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SSP2Q08646 371 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SWT1Q12104 458 aa2.01□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C CHO1P08456 276 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TY2A-LR1P0C2J4 438 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TY2A-FP0CX61 438 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TY2A-GR2P0CX62 438 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C SPO16P17122 198 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TY2A-CP25383 438 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C FMP46P36141 133 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C RPN11P43588 306 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TY2A-DR2Q03483 438 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TMA16Q08687 178 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TY2A-BQ12260 438 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TY2A-OR2Q12293 438 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TY2A-DR1Q12392 438 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TY2A-OR1Q12439 438 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TY2A-DR3Q99303 438 aa2□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C TOP1P04786 769 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C GUK1P15454 187 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C CNS1P33313 385 aa1.99□□□□□ -2.09
HDA3YPR179C RRN3P36070 627 aa1.99□□□□□ -2.09
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