RNA–Protein interactions for RNA: YNR042W

YNR042W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNR042W, Length 429 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR042W	YNR042W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	LAG2	Q92325	660 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	MDM35	O60200	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	CDC26	P14724	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	ATO2	P32907	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	CAB3	P36076	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	COG4	Q06096	861 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	AKR2	Q12013	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	HER1	Q12276	1246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	NSI1	Q12457	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	NHA1	Q99271	985 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNR042W	YNR042W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	DCC1	P25559	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	ORC2	P32833	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	LST4	P34239	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PCL5	P38794	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	BEM4	P39011	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	YEL020C	P39994	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	YIL054W	P40524	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	TCB2	P48231	1178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	TIM13	P53299	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	TPP1	Q03796	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	HDA3	Q06623	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	TEN1	Q07921	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	CIR2	Q08822	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	SEY1	Q99287	776 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	COX1	P00401	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	CLC1	P17891	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	MCM2	P29469	868 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	NFU1	P32860	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	SAP30	P38429	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	MBP1	P39678	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	KHA1	P40309	873 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	CIR1	P42940	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	YJL107C	P42947	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PUS2	P53167	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	LSC2	P53312	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YNR042W	YNR042W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	APL1	P27351	700 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	BUD14	P27637	709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	MCM7	P38132	845 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	DBP8	P38719	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	YEL073C	P39974	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	IRR1	P40541	1150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PMT4	P46971	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	FRE4	P53746	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	BSC5	P53755	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	ROT1	Q03691	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	LDB18	Q07887	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	TPO4	Q12256	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	COX17	Q12287	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	OCA6	Q12454	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PHO2	P07269	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	EMC1	P25574	760 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	KIP2	P28743	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PHO11	P35842	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	YRO2	P38079	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	VHC1	P38329	1120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PHO12	P38693	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YNR042W	YNR042W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	CCE1	Q03702	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	BUD7	Q08754	746 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	GPM3	Q12326	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	FRT1	Q99332	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	BI2	P03873	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	YSR3	P23501	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	AEP1	P32493	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	SFA1	P32771	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	RSM22	P36056	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNR042W	YNR042W	BIT2	P38346	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.2 ms