RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	MTF2	P10849	440 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	BIK1	P11709	440 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YCR006C	P25350	157 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YBR138C	P38277	524 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	PHM8	P40025	321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YIL169C	P40442	995 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	OPY2	Q06810	360 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	BAG7	Q12128	409 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	RRN3	P36070	627 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	SKP2	P42843	763 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	UBP8	P50102	471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	IMA1	P53051	589 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	MEP3	P53390	489 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	CAC2	Q04199	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	FRE3	Q08905	711 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	PCT1	P13259	424 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	RAD16	P31244	790 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	IFA38	P38286	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	UME6	P39001	836 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	PCL6	P40038	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	TMA108	P40462	946 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	DJP1	P40564	432 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	BNA1	P47096	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	SWF1	Q04629	336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	GRS2	Q06817	618 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	GPA1	P08539	472 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	VID22	Q05934	901 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	POS5	Q06892	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	RRI2	Q12348	645 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
MGR3	YMR115W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	IZH1	Q03419	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	ATG23	Q06671	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	NRT1	Q08485	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	YSP3	P25036	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	MNN2	P38069	597 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	NPR3	P38742	1146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	AXL2	P38928	823 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	ASG1	P40467	964 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	TRM8	Q12009	286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	CTF18	P49956	741 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	BET4	Q00618	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	ARP9	Q05123	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	STP3	Q05937	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	TPK1	P06244	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	CNS1	P33313	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	ZAP1	P47043	880 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	CBK1	P53894	756 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	ECI1	Q05871	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	COX17	Q12287	69 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	ENT1	Q12518	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	INH1	P01097	85 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	RTT107	P38850	1070 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	YER010C	P40011	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	TFC6	Q06339	672 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MGR3	YMR115W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	YEL068C	P39977	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	YND1	P40009	630 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	SAD1	P43589	448 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	SAN1	P22470	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	ESBP6	P53918	673 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	PCD1	Q12524	340 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	GEX2	P36173	615 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	UBP13	P38187	747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	RKM3	P38222	552 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	VRG4	P40107	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MGR3	YMR115W	NDE1	P40215	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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