RNA–Protein interactions for RNA: YOR118W

RTC5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RTC5, Length 1,704 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC5	YOR118W	ERP6	P53198	216 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	YGR045C	P53229	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	BIO4	P53630	237 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	MUB1	Q03162	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	HOT1	Q03213	719 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	OSW1	Q08692	278 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	AVL9	Q12500	764 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	YSC84	P32793	468 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
RTC5	YOR118W	MSR1	P38714	643 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	TVP23	P38962	199 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	DSE1	P40077	573 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	LAM5	P43560	674 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	YFL012W	P43580	148 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	SAE2	P46946	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	PFD1	P46988	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	IZH4	Q99393	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	GAL11	P19659	1081 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	MRPL25	P23369	157 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	ARE1	P25628	610 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	HEL1	P36113	551 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	GPT2	P36148	743 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	DRE2	P36152	348 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	MRPL7	P36519	292 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	ETR1	P38071	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	MBP1	P39678	833 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	SCC4	P40090	624 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	YJL107C	P42947	387 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	RRT5	P43607	289 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	HLJ1	P48353	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	YET3	Q07451	203 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	IMA2	Q08295	589 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	VPS5	Q92331	675 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTC5	YOR118W	TPK1	P06244	397 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	NFS1	P25374	497 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	SET3	P36124	751 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	STN1	P38960	494 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	YDR089W	P38966	869 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	ERP2	P39704	215 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	SND1	Q04007	877 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	THI21	Q08975	551 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	SUT2	Q12286	268 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	UBR1	P19812	1950 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	CAN1	P04817	590 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	RAD3	P06839	778 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	SNA3	P14359	133 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	AAD3	P25612	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	CSE2	P33308	149 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	HSM3	P38348	480 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	CKB2	P38930	258 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	LYS9	P38999	446 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	ALR2	P43553	858 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	AZR1	P50080	613 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	YML119W	Q03208	357 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	ICL2	Q12031	575 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	GNT1	Q12096	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	RTP1	Q12751	981 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
RTC5	YOR118W	TSR4	P25040	408 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	GID7	P25569	745 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	GAC1	P28006	793 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	RFC3	P38629	340 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	YHL026C	P38740	315 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	PPE1	P38796	400 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	YAP1801	P38856	637 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	CHS6	P40955	746 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	GCV2	P49095	1034 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	BUD9	P53226	547 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	YGR127W	P53275	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	SPC98	P53540	846 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTC5	YOR118W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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