RNA–Protein interactions for RNA: YDR169C

STB3, Transcript of Ribosomal RNA processing element (RRPE)-binding protein, yeast

Gene STB3, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB3	YDR169C	KHA1	P40309	873 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	IRC5	P43610	853 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	VID30	P53076	958 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	PEX15	Q08215	383 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	URK1	P27515	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	SSH4	P32343	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	MTH1	P35198	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	CTP1	P38152	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	RIM4	P38741	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	SAD1	P43589	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	UBA2	P52488	636 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	LSB1	P53281	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	YGR151C	P53287	111 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	MAK31	P23059	88 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	FUB1	P25659	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	NFU1	P32860	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	PTH2	P34222	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	YHL041W	P38730	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	YEL076C	P39971	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	TMN3	P40071	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	EMP65	P40085	556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	ARG2	P40360	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	ATG4	P53867	494 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	MLC2	Q06580	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	ERP4	Q12450	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STB3	YDR169C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	HMG2	P12684	1045 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	DBF20	P32328	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
STB3	YDR169C	EHT1	P38295	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	HIS6	P40545	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	YDL183C	P48569	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	FDC1	Q03034	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	YML131W	Q03102	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	TFC6	Q06339	672 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	IZH3	Q07959	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	RIM20	Q12033	661 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	NTH1	P32356	751 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	PNG1	Q02890	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	NKP2	Q06162	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	TEL1	P38110	2787 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	ABF1	P14164	731 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	ELF1	P36053	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	YJL206C	P39529	758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	NMA2	P53204	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	PSR2	Q07949	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	IRA2	P19158	3079 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	KIN3	P22209	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	IMP2'	P32351	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	BDH2	P39713	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	ASE1	P50275	885 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	MNT2	P53059	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	HOL1	P53389	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	SNF12	P53628	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	HLR1	Q04429	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	DSE3	Q08729	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	RKI1	Q12189	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	TAF3	Q12297	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	INH1	P01097	85 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	GLG1	P36143	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	DRE2	P36152	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	OPT1	P40897	799 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	PEF1	P53238	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	DIP5	P53388	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	IRC10	Q08118	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	ARP6	Q12509	438 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	CCH1	P50077	2039 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	MSS51	P32335	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	TVP38	P36164	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	STB5	P38699	743 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB3	YDR169C	STL1	P39932	569 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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