RNA–Protein interactions for RNA: YBR167C

POP7, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP7, Length 423 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP7	YBR167C	NUP120	P35729	1037 aa		3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	MRPL36	P36531	177 aa		3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	PSF2	P40359	213 aa		3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	CDC1	P40986	491 aa		3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	MSY1	P48527	492 aa		3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	VTC3	Q02725	835 aa		3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	PDR8	Q06149	701 aa		3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	ATG23	Q06671	453 aa		3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	BAG7	Q12128	409 aa		3.79	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.79	□□□□□ -1.8	not detected
POP7	YBR167C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	MSM1	P22438	575 aa		3.78	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	YCR006C	P25350	157 aa		3.78	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	OCT1	P35999	772 aa		3.78	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	IRC8	P47046	822 aa		3.78	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	MCH4	Q08268	501 aa		3.78	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	ATX2	Q12067	313 aa		3.78	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	SWT1	Q12104	458 aa		3.78	□□□□□ -1.8
POP7	YBR167C	NUC1	P08466	329 aa		3.77	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	YML003W	P0CF16	290 aa		3.77	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	ASG1	P40467	964 aa		3.77	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	MDV1	P47025	714 aa		3.77	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	SWA2	Q06677	668 aa		3.77	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	VAM6	Q07468	1049 aa		3.77	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	PCT1	P13259	424 aa		3.76	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	YCL049C	P25577	312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	BLS1	Q06071	122 aa		3.76	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	COX17	Q12287	69 aa		3.76	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TPK1	P06244	397 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	SPO16	P17122	198 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	YSP3	P25036	478 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	EXO84	P38261	753 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	NPR3	P38742	1146 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	PHM8	P40025	321 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	VPS25	P47142	202 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	UBP8	P50102	471 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	SCS3	P53012	380 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	COG1	P53079	417 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	MRPL13	Q02204	264 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	CIA1	Q05583	330 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	SNA4	Q07549	140 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.75	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	GPA1	P08539	472 aa		3.74	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	RAD16	P31244	790 aa		3.74	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	DBF20	P32328	564 aa		3.74	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	ATO2	P32907	282 aa		3.74	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	BOP3	P53958	396 aa		3.74	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	PIG1	Q06216	648 aa		3.74	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	DSE3	Q08729	430 aa		3.74	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	UBX3	Q12229	455 aa		3.74	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TY2A-C	P25383	438 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	PXL1	P36166	706 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	UBP13	P38187	747 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	IFA38	P38286	347 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TPM2	P40414	161 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	SMK1	P41808	388 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	ASE1	P50275	885 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	CRN1	Q06440	651 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	GSH2	Q08220	491 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	FRE3	Q08905	711 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	PCD1	Q12524	340 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.73	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	MTF2	P10849	440 aa		3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	PTH2	P34222	208 aa		3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	LHS1	P36016	881 aa		3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	VPS41	P38959	992 aa		3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	FCP1	Q03254	732 aa		3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	PFA5	Q03289	374 aa		3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	IOC4	Q04213	475 aa		3.72	□□□□□ -1.81
POP7	YBR167C	TDA9	Q04545	1251 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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