RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C GSH1P32477 678 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C TAF5P38129 798 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YLF2P38746 405 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C SWD1P39706 426 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C IDS2P46958 469 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ACS1Q01574 713 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ATX2Q12067 313 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ARP7Q12406 477 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YOR111WQ99210 232 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ILS1P09436 1072 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C VBA2P38358 474 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C IMA5P40884 581 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YJL107CP42947 387 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C QRI7P43122 407 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C EAF7P53911 425 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C TEP1P53916 434 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C HIM1Q06674 414 aa2.14□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C PIF1P07271 859 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C MSS18P08593 268 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C CNA1P23287 553 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C GCS1P35197 352 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C GND1P38720 489 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YHL041WP38730 149 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ERC1P38767 581 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C MTG2P38860 518 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ARB1P40024 610 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C VFA1P40080 203 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C MDV1P47025 714 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C MAD3P47074 515 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YML053CQ04978 212 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C BUD7Q08754 746 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YBR255C-AQ3E776 120 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YER175W-AQ8TGU4 54 aa2.13□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YFL068WP0CX99 160 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YLL066W-AP0CY00 160 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YLL067W-AP0CY01 160 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C RPT3P33298 428 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C FLO5P38894 1075 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C TPA1P40032 644 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C CDC1P40986 491 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C UBX4P54730 416 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C MOT3P54785 490 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C BRE1Q07457 700 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C CRD1Q07560 283 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C AIM6Q07716 390 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C NDD1Q08887 554 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C PFA4Q12006 378 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C UBX3Q12229 455 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C PGI1P12709 554 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C SEC18P18759 758 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C MSH1P25846 959 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C FRD1P32614 470 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C APM3P38153 483 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ARN1P38731 627 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C AAD4Q07747 329 aa2.12□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C APA1P16550 321 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C STT3P39007 718 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YAT2P40017 923 aa2.11□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C VPS27P40343 622 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C MAF1P41910 395 aa2.11□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C PAP2P53632 584 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C CRF1Q04930 467 aa2.11□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C MLH2Q07980 695 aa2.11□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C CTT1P06115 562 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C PHO81P17442 1178 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YCR043CP25361 127 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C PTC6P25646 442 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C RPS7AP26786 190 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C VPS41P38959 992 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C SPC72P39723 622 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ACA1P39970 489 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C TES1P41903 349 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ORC5P50874 479 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ESF2P53743 316 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C BOP3P53958 396 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C VPS64Q03944 604 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C SNA4Q07549 140 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C RRI1Q12468 440 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C POL3P15436 1097 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C SIR1P21691 654 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C MCM3P24279 971 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C HES1P35843 434 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C RPF2P36160 344 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ARC40P38328 384 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C PHM8P40025 321 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C DSE3Q08729 430 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YOR389WQ08912 624 aa2.1□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data2.1□□□□□ -2.07not detected
HDA3YPR179C PDE1P22434 369 aa2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C SWI4P25302 1093 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C LNP1P38878 278 aa2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C RPT2P40327 437 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YIR016WP40572 265 aa2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C NPA3P47122 385 aa2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YPR003CP53394 754 aa2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C CPR6P53691 371 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data2.09□□□□□ -2.07not detected
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