RNA–Protein interactions for RNA: YNR001C

CIT1, Transcript of Citrate synthase, yeast

Gene CIT1, Length 1,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIT1	YNR001C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	PES4	P39684	611 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	YJR061W	P40355	935 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	CAB2	P40506	365 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	RMD8	P43620	662 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	SSY5	P47002	699 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	RNT1	Q02555	471 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	ATG21	Q02887	496 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	RAD9	P14737	1309 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	MNE1	P24720	663 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	DPH2	P32461	534 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	MDL1	P33310	695 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	SET3	P36124	751 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	YBR138C	P38277	524 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	MEP1	P40260	492 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	YJL068C	P40363	299 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	MAD2	P40958	196 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	MNT2	P53059	558 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	CIK1	Q01649	594 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	RMT2	Q03305	412 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	CRD1	Q07560	283 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	AAD4	Q07747	329 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	ENB1	Q08299	606 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	PGC1	Q08959	321 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	COX17	Q12287	69 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	RAV1	P47104	1357 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	CWH43	P25618	953 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	NPR2	P39923	615 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	PZF1	P39933	429 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	DJP1	P40564	432 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	TEL2	P53038	688 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	YNR071C	P53757	342 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	YML122C	Q03207	126 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	PPN1	Q04119	674 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	YPS7	Q06325	596 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	HSP42	Q12329	375 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CIT1	YNR001C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.03	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	PDR11	P40550	1411 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	SPE2	P21182	396 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	OCA4	P25366	362 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	SWC3	P31376	625 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	ERG3	P32353	365 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	PET127	P32606	800 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	PXA1	P41909	870 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	TAF4	P50105	388 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	ZDS2	P54786	942 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	VPS60	Q03390	229 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	VTI1	Q04338	217 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	SGO1	Q08490	590 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	RCN2	Q12044	265 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	DIN7	Q12086	430 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	TRM13	Q12383	476 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	RTN2	Q12443	393 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	SAK1	P38990	1142 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	PEF1	P53238	335 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	SEC5	P89102	971 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	ACS1	Q01574	713 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	TFC6	Q06339	672 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	STP4	Q07351	490 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	AIM39	Q08223	395 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	VMR1	P38735	1592 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CIT1	YNR001C	CTT1	P06115	562 aa		4	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.5 ms