RNA–Protein interactions for RNA: YJL145W

SFH5, Transcript of Non-classical phosphatidylinositol transfer protein (PITP), yeast

Gene SFH5, Length 885 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFH5	YJL145W	YMC2	P38087	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	YPT10	P38146	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	MOH1	P38191	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	MIT1	P40002	666 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	YJR061W	P40355	935 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	UBX6	P47049	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	COG2	P53271	262 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	GND2	P53319	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SFH5	YJL145W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	CDC16	P09798	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	AMD2	P22580	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	GDA1	P32621	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	OAR1	P35731	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	NDE1	P40215	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	LAS21	P40367	830 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	IMO32	P53219	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	CTF4	Q01454	927 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	WAR1	Q03631	944 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	YML053C	Q04978	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	NUS1	Q12063	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	PNS1	Q12412	539 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFH5	YJL145W	PRE8	P23639	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	IMP2'	P32351	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	MRP20	P32387	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	MUP3	P38734	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	FCP1	Q03254	732 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	GTB1	Q04924	702 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	ATG23	Q06671	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	MED1	Q12321	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	ERG8	P24521	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	MTH1	P35198	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	JNM1	P36224	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	PSD1	P39006	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	CPR8	P53728	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	HUA2	Q12134	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	RTP1	Q12751	981 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	COX1	P00401	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	TFC3	P34111	1160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	TDP1	P38319	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	VPS8	P39702	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	BUD16	P39988	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	NPA3	P47122	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	VPS4	P52917	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	YGL117W	P53133	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	YNL092W	P53934	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	PLM2	Q04383	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	TMN2	Q04562	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	RCO1	Q04779	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	VCX1	Q99385	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	SEM1	O94742	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	CDC15	P27636	974 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	ALY1	P36117	915 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	UBP7	P40453	1071 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	DJP1	P40564	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	SLI1	P53304	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	ENT4	Q07872	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	PCL8	Q08966	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	LCB4	Q12246	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	RPN13	O13563	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	YBL029W	P38201	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	ERC1	P38767	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	OPT1	P40897	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	YFL015C	P43578	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	RAD30	Q04049	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	RAD33	Q04231	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	MRP7	P12687	371 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	SPO11	P23179	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFH5	YJL145W	LAC1	P28496	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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