RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	YDR338C	Q05497	695 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	YLR053C	Q12026	108 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	HRT3	Q12347	344 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	HAP2	P06774	265 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	ARG1	P22768	420 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	GID7	P25569	745 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	ADK2	P26364	225 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	HSP78	P33416	811 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	GIP1	P38229	639 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	SLX1	P38324	304 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	BIT2	P38346	545 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	PPE1	P38796	400 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	RAD55	P38953	406 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	ATM1	P40416	690 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	MND2	P40577	368 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	RTA1	P53047	317 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	PEX31	P53203	462 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	ARA2	Q04212	335 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	AAD4	Q07747	329 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	VHS3	Q08438	674 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YCK1	YHR135C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.28	□□□□□ -1.4	not detected
YCK1	YHR135C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	TSR4	P25040	408 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	AAD3	P25612	363 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	GCS1	P35197	352 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SET3	P36124	751 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YBR284W	P38150	797 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ECM1	P39715	212 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	CNN1	P43618	361 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YNR040W	P53736	256 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MSH6	Q03834	1242 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SND1	Q04007	877 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	APM4	Q99186	491 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	NHA1	Q99271	985 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ERR1	P0CX10	437 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ERR2	P0CX11	437 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PMR1	P13586	950 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YIH1	P25637	258 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.26	□□□□□ -1.41	RIP-Chip
YCK1	YHR135C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YHR202W	P38887	602 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SKN7	P38889	622 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	FHL1	P39521	936 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YAT2	P40017	923 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	FIR1	P40020	876 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ERR3	P42222	437 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PCL10	P53124	433 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YPR003C	P53394	754 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.26	□□□□□ -1.41	not detected
YCK1	YHR135C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	VPS9	P54787	451 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SHE9	Q04172	456 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RSC2	Q06488	889 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	NRT1	Q08485	598 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	GPM3	Q12326	303 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ARP7	Q12406	477 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	URA10	P30402	227 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YSC84	P32793	468 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ALG14	P38242	237 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	REV7	P38927	245 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PRM9	P39551	298 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	OPT1	P40897	799 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YJL107C	P42947	387 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SPO74	P45819	413 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	NUT1	P53114	1132 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	VPS16	Q03308	798 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	AIM32	Q04689	311 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ARP9	Q05123	467 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	APC5	Q08683	685 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SLP1	Q12232	587 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ADY2	P25613	283 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.25	□□□□□ -1.41	RIP-Chip
YCK1	YHR135C	HMT1	P38074	348 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MED8	P38304	223 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YJL206C	P39529	758 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YEL028W	P39989	153 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	IML2	P47031	731 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41

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