RNA–Protein interactions for RNA: Q0060

AI3, Transcript of Endonuclease I-SceIII, yeast

Gene AI3, Length 1,248 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI3	Q0060	YLR112W	Q12130	139 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AI3	Q0060	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	VPS41	P38959	992 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	CDC1	P40986	491 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	ERC1	P38767	581 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	STL1	P39932	569 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	SKP2	P42843	763 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	QRI7	P43122	407 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	YPL191C	Q08930	360 aa		4.7	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	MNN2	P38069	597 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	IZH1	Q03419	316 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	PDR8	Q06149	701 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	THI3	Q07471	609 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	MSS51	P32335	436 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	PCL6	P40038	420 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	NIT2	P47016	307 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	SPC105	P53148	917 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	TRS31	Q03337	283 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	FMP42	Q04991	504 aa		4.68	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	VFA1	P40080	203 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	NPA3	P47122	385 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	VPS25	P47142	202 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	TIP41	Q12199	356 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AI3	Q0060	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	ASG1	P40467	964 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	SIP1	P32578	815 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	OCT1	P35999	772 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	YBR139W	P38109	508 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	RKM3	P38222	552 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	POL31	P46957	487 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	DOS2	P54858	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	CDC23	P16522	626 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	SLD3	P53135	668 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	ESBP6	P53918	673 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	ARP9	Q05123	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	PIG1	Q06216	648 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	HOL1	P53389	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	YLR281C	Q05863	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	FRE3	Q08905	711 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	CTT1	P06115	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	SND1	Q04007	877 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	CAC2	Q04199	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	MCH4	Q08268	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	COX1	P00401	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	EFM2	P38347	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	BZZ1	P38822	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	YNL034W	P53963	612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	YLR352W	Q06479	807 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI3	Q0060	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	POS5	Q06892	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	YCR006C	P25350	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	LAC1	P28496	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	TRI1	Q05024	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	PSF3	Q12146	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	HNM1	P19807	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	YMR254C	Q04838	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	PDE1	P22434	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	UBP8	P50102	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	PEX15	Q08215	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	GPA1	P08539	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	AIM6	Q07716	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	TGL1	P34163	548 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	TAH18	Q12181	623 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI3	Q0060	CBP1	P07252	654 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	IMA5	P40884	581 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	CUL3	P53202	744 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	YGR079W	P53249	370 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	CRZ1	P53968	678 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	VPS64	Q03944	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	ECI1	Q05871	280 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	TRE2	Q08693	809 aa		4.52	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	ADH4	P10127	382 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	PHO3	P24031	467 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	HES1	P35843	434 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	KRE9	P39005	276 aa		4.51	□□□□□ -1.69
AI3	Q0060	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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