RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa14,43□□□□□ -0,1
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Suds3-201ENSMUST00000086471 6030445D17RikE9Q8F9 148 aa14,41□□□□□ -0,1
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pkd1O08852 4293 aa14,4□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vpreb1P13372 142 aa14,39□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 A830005F24RikQ8BRT5 167 aa14,39□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa14,39□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vpreb3D3Z6J4 130 aa14,38□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 OxtP35454 125 aa14,38□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 PkigO70139 76 aa14,37□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm17521F6QAC8 156 aa14,37□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm10642Q3TWM1 71 aa14,35□□□□□ -0,11
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Suds3-201ENSMUST00000086471 P06320 134 aa14,35□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krtap13O88375 197 aa14,34□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Smim20D3Z7Q2 69 aa14,34□□□□□ -0,11
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP14,32□□□□□ -0,12
Suds3-201ENSMUST00000086471 MplkipQ9D011 178 aa14,32□□□□□ -0,12
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm37389A0A0A6YW05 95 aa14,31□□□□□ -0,12
Suds3-201ENSMUST00000086471 Igkv8-21A0A140T8P7 120 aa14,31□□□□□ -0,12
Suds3-201ENSMUST00000086471 Adm2Q7TNK8 150 aa14,31□□□□□ -0,12
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ormdl1Q921I0 153 aa14,31□□□□□ -0,12
Suds3-201ENSMUST00000086471 Apoc4Q61268 124 aa14,3□□□□□ -0,12
Suds3-201ENSMUST00000086471 SmcpP15265 143 aa14,3□□□□□ -0,12
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm10308Q9CVR5 141 aa14,29□□□□□ -0,12
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cox6a2P43023 97 aa14,29□□□□□ -0,12
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ube2aQ9Z255 152 aa14,28□□□□□ -0,12
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm10401E9Q3K6 71 aa14,26□□□□□ -0,13
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sfta2E9PXB6 77 aa14,26□□□□□ -0,13
Suds3-201ENSMUST00000086471 A330070K13RikQ8CA53 115 aa14,25□□□□□ -0,13
Suds3-201ENSMUST00000086471 ApobE9Q414 4505 aa14,24□□□□□ -0,13
Suds3-201ENSMUST00000086471 1700018G05RikA0A1B0GSI2 66 aa14,24□□□□□ -0,13
Suds3-201ENSMUST00000086471 Igf1P05017 153 aa14,24□□□□□ -0,13
Suds3-201ENSMUST00000086471 D130052B06RikQ3UW13 202 aa14,23□□□□□ -0,13
Suds3-201ENSMUST00000086471 Defa25Q5G864 92 aa14,23□□□□□ -0,13
Suds3-201ENSMUST00000086471 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa14,21□□□□□ -0,13
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa14,2□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP14,2□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm17689B3GLJ4 109 aa14,2□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 AI606181Q8C7B9 129 aa14,2□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa14,2□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa14,18□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krtap14O08640 167 aa14,18□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Inafm2A0A1L1STD6 152 aa14,17□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Odf3bQ5M8M2 238 aa14,17□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa14,17□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm27235Q3UW50 83 aa14,17□□□□□ -0,14
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Hectd4E9Q2E4 4418 aa14,15□□□□□ -0,14
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cystm1Q8K353 104 aa14,14□□□□□ -0,15
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP14,13□□□□□ -0,15
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Pde6gP09174 87 aa14,11□□□□□ -0,15
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm44790A0A0N4SV91 103 aa14,1□□□□□ -0,15
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmem254cP0DN91 123 aa14,07□□□□□ -0,16
Suds3-201ENSMUST00000086471 C130032M10RikQ8C888 123 aa14,06□□□□□ -0,16
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam19a3Q7TPG6 132 aa13,91□□□□□ -0,18
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Rpl37aP61514 92 aa13,78□□□□□ -0,2
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmem258P61166 79 aa13,76□□□□□ -0,21
Suds3-201ENSMUST00000086471 SacsQ9JLC8 4582 aa13,76□□□□□ -0,21
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc179J3QM76 67 aa13,76□□□□□ -0,21
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