Protein–RNA interactions for Protein: Q5G864

Defa25, Alpha-defensin 25, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa25Q5G864 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Defa25Q5G864 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa25Q5G864 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa25Q5G864 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Defa25Q5G864 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Defa25Q5G864 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Defa25Q5G864 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa25Q5G864 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa25Q5G864 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Defa25Q5G864 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa25Q5G864 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa25Q5G864 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa25Q5G864 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa25Q5G864 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Defa25Q5G864 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Defa25Q5G864 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Defa25Q5G864 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Defa25Q5G864 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Defa25Q5G864 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Defa25Q5G864 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Defa25Q5G864 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Defa25Q5G864 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Defa25Q5G864 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Defa25Q5G864 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Defa25Q5G864 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa25Q5G864 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa25Q5G864 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa25Q5G864 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa25Q5G864 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa25Q5G864 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa25Q5G864 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa25Q5G864 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Defa25Q5G864 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa25Q5G864 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa25Q5G864 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa25Q5G864 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa25Q5G864 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa25Q5G864 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa25Q5G864 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa25Q5G864 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa25Q5G864 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa25Q5G864 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa25Q5G864 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa25Q5G864 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa25Q5G864 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa25Q5G864 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa25Q5G864 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa25Q5G864 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa25Q5G864 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa25Q5G864 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa25Q5G864 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa25Q5G864 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa25Q5G864 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa25Q5G864 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa25Q5G864 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa25Q5G864 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa25Q5G864 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa25Q5G864 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa25Q5G864 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa25Q5G864 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa25Q5G864 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa25Q5G864 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa25Q5G864 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa25Q5G864 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa25Q5G864 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa25Q5G864 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa25Q5G864 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa25Q5G864 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa25Q5G864 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa25Q5G864 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa25Q5G864 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa25Q5G864 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa25Q5G864 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa25Q5G864 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa25Q5G864 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa25Q5G864 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa25Q5G864 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa25Q5G864 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa25Q5G864 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa25Q5G864 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa25Q5G864 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa25Q5G864 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Defa25Q5G864 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa25Q5G864 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa25Q5G864 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa25Q5G864 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa25Q5G864 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa25Q5G864 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa25Q5G864 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa25Q5G864 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa25Q5G864 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa25Q5G864 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa25Q5G864 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa25Q5G864 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa25Q5G864 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa25Q5G864 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa25Q5G864 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa25Q5G864 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa25Q5G864 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa25Q5G864 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms