Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ApobE9Q414 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ApobE9Q414 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ApobE9Q414 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ApobE9Q414 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ApobE9Q414 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ApobE9Q414 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApobE9Q414 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApobE9Q414 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ApobE9Q414 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ApobE9Q414 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ApobE9Q414 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ApobE9Q414 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobE9Q414 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ApobE9Q414 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ApobE9Q414 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApobE9Q414 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ApobE9Q414 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ApobE9Q414 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ApobE9Q414 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ApobE9Q414 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ApobE9Q414 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ApobE9Q414 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ApobE9Q414 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ApobE9Q414 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ApobE9Q414 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ApobE9Q414 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobE9Q414 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ApobE9Q414 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ApobE9Q414 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ApobE9Q414 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ApobE9Q414 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ApobE9Q414 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ApobE9Q414 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ApobE9Q414 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ApobE9Q414 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ApobE9Q414 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApobE9Q414 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ApobE9Q414 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ApobE9Q414 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobE9Q414 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobE9Q414 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApobE9Q414 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ApobE9Q414 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ApobE9Q414 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ApobE9Q414 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ApobE9Q414 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ApobE9Q414 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ApobE9Q414 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApobE9Q414 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApobE9Q414 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ApobE9Q414 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ApobE9Q414 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ApobE9Q414 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ApobE9Q414 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ApobE9Q414 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ApobE9Q414 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ApobE9Q414 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApobE9Q414 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobE9Q414 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobE9Q414 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobE9Q414 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobE9Q414 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobE9Q414 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobE9Q414 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApobE9Q414 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApobE9Q414 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobE9Q414 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobE9Q414 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobE9Q414 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ApobE9Q414 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ApobE9Q414 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobE9Q414 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobE9Q414 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobE9Q414 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobE9Q414 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApobE9Q414 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApobE9Q414 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApobE9Q414 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApobE9Q414 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobE9Q414 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApobE9Q414 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ApobE9Q414 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApobE9Q414 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobE9Q414 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApobE9Q414 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ApobE9Q414 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApobE9Q414 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ApobE9Q414 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ApobE9Q414 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ApobE9Q414 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApobE9Q414 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApobE9Q414 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ApobE9Q414 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApobE9Q414 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApobE9Q414 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobE9Q414 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobE9Q414 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApobE9Q414 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApobE9Q414 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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