Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
ApobE9Q414 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
ApobE9Q414 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
ApobE9Q414 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21,85■■□□□ 1,09
ApobE9Q414 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,48■■□□□ 1,03
ApobE9Q414 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,19■□□□□ 0,98
ApobE9Q414 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
ApobE9Q414 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
ApobE9Q414 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
ApobE9Q414 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
ApobE9Q414 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,62■□□□□ 0,89
ApobE9Q414 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
ApobE9Q414 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20,43■□□□□ 0,86
ApobE9Q414 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20,33■□□□□ 0,84
ApobE9Q414 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
ApobE9Q414 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
ApobE9Q414 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,82
ApobE9Q414 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,08■□□□□ 0,8
ApobE9Q414 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
ApobE9Q414 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19,92■□□□□ 0,78
ApobE9Q414 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19,89■□□□□ 0,77
ApobE9Q414 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
ApobE9Q414 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,71■□□□□ 0,75
ApobE9Q414 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
ApobE9Q414 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19,68■□□□□ 0,74
ApobE9Q414 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
ApobE9Q414 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19,49■□□□□ 0,71
ApobE9Q414 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
ApobE9Q414 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
ApobE9Q414 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,39■□□□□ 0,69
ApobE9Q414 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
ApobE9Q414 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
ApobE9Q414 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,29■□□□□ 0,68
ApobE9Q414 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
ApobE9Q414 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,2■□□□□ 0,66
ApobE9Q414 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19,19■□□□□ 0,66
ApobE9Q414 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19,06■□□□□ 0,64
ApobE9Q414 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19,06■□□□□ 0,64
ApobE9Q414 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19,06■□□□□ 0,64
ApobE9Q414 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
ApobE9Q414 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,99■□□□□ 0,63
ApobE9Q414 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
ApobE9Q414 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18,91■□□□□ 0,62
ApobE9Q414 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
ApobE9Q414 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,62
ApobE9Q414 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC18,84■□□□□ 0,61
ApobE9Q414 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18,84■□□□□ 0,61
ApobE9Q414 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
ApobE9Q414 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18,75■□□□□ 0,59
ApobE9Q414 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
ApobE9Q414 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18,71■□□□□ 0,59
ApobE9Q414 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
ApobE9Q414 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18,66■□□□□ 0,58
ApobE9Q414 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18,66■□□□□ 0,58
ApobE9Q414 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18,64■□□□□ 0,57
ApobE9Q414 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
ApobE9Q414 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18,63■□□□□ 0,57
ApobE9Q414 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18,53■□□□□ 0,56
ApobE9Q414 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18,5■□□□□ 0,55
ApobE9Q414 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18,49■□□□□ 0,55
ApobE9Q414 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18,48■□□□□ 0,55
ApobE9Q414 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
ApobE9Q414 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18,44■□□□□ 0,54
ApobE9Q414 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18,42■□□□□ 0,54
ApobE9Q414 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
ApobE9Q414 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
ApobE9Q414 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
ApobE9Q414 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
ApobE9Q414 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18,34■□□□□ 0,53
ApobE9Q414 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
ApobE9Q414 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18,28■□□□□ 0,52
ApobE9Q414 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18,21■□□□□ 0,51
ApobE9Q414 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18,21■□□□□ 0,51
ApobE9Q414 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
ApobE9Q414 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
ApobE9Q414 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
ApobE9Q414 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
ApobE9Q414 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
ApobE9Q414 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
ApobE9Q414 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
ApobE9Q414 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
ApobE9Q414 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18,09■□□□□ 0,49
ApobE9Q414 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,08■□□□□ 0,49
ApobE9Q414 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
ApobE9Q414 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
ApobE9Q414 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18,03■□□□□ 0,48
ApobE9Q414 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18,02■□□□□ 0,48
ApobE9Q414 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0,47
ApobE9Q414 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17,98■□□□□ 0,47
ApobE9Q414 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
ApobE9Q414 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
ApobE9Q414 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17,92■□□□□ 0,46
ApobE9Q414 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17,92■□□□□ 0,46
ApobE9Q414 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17,9■□□□□ 0,46
ApobE9Q414 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
ApobE9Q414 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
ApobE9Q414 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,85■□□□□ 0,45
ApobE9Q414 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,85■□□□□ 0,45
ApobE9Q414 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
ApobE9Q414 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms